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中国荷斯坦牛乳房炎易感性及抗性的全基因组关联分析
  • ISSN号:0366-6964
  • 期刊名称:《畜牧兽医学报》
  • 时间:0
  • 分类:S823[农业科学—畜牧学;农业科学—畜牧兽医]
  • 作者机构:[1]中国农业大学动物科技学院,北京100193, [2]西北农林科技大学理学院,杨凌712100
  • 相关基金:国家自然科学基金(31272420);农业部奶业体系项目(CARS-37-04B);“十二五”国家科技支持项目(2011BAD28802);“863”重大项目(2008AAl01002);教育部基本科研项目(2011]S006,Z109021306);长江学者与创新团队发展计划(IRTll91)
中文摘要:

本研究首先通过SAS9.1分析2093头北京地区中国荷斯坦牛体细胞数(SCC)的变化规律,依据SCC将牛只划分为乳房炎易感牛(Case)及抗性牛(Contr01);再基于Case-control设计进行全基因组关联分析。通过染色体水平的Bonferroni校正,共检测到6个SNPs与乳房炎易感性及抗性显著相关。其中19号染色体检测出的显著SNP(ARS-BFGI,NGS-78516,P-5.20065e-05)在其200kb范围内共有3个基因(PRKRIP1、ARHGAP23和TBX21)与炎症反应密切相关。研究结果为奶牛乳房炎易感性及抗性的分子遗传基础研究提供了数据。

英文摘要:

Abstract.. The variation trends of somatic cell count (SCC) were analyzed using SAS 9.1. According to the SCC data, in 2 093 Chinese Holsteins in Beijing all of the cows were divided into two groups, mastitis susceptive cows (case) and resistant cows (control). Based on case-control de- sign, genome-wide association study was further performed. The results showed that six SNPs were significantly relevant to mastitis susceptibility or resistance after Bonferroni adjusting on the chromosome level. Three genes (PRKRIP1, ARHGAP23, TBX21) on BTA19 closely related to inflammation response were discovered near the significant SNP (ARS-BFGL-NGS-78516, P = 5.20e-05) within 200 kb. The results provide fundamental data for molecular genetics of mastitis resistance in dairy cattle.

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期刊信息
  • 《畜牧兽医学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中国科学技术协会
  • 主办单位:中国畜牧兽医学会
  • 主编:文杰
  • 地址:北京海淀区圆明园西路2号中国农科院畜牧所
  • 邮编:100193
  • 邮箱:xmsyxb@263.net
  • 电话:010-62815987 62816996
  • 国际标准刊号:ISSN:0366-6964
  • 国内统一刊号:ISSN:11-1985/S
  • 邮发代号:82-453
  • 获奖情况:
  • 1992年北京优秀期刊奖,1998年、2000年在全国畜牧兽医优秀期刊评比中获一等奖
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,波兰哥白尼索引,美国剑桥科学文摘,英国动物学记录,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),瑞典开放获取期刊指南,中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:21857