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基于DGGE分析的大鼠粪便及肠道细菌DNA提取方法研究
  • ISSN号:1002-6630
  • 期刊名称:食品科学
  • 时间:2011
  • 页码:215-218
  • 分类:Q523[生物学—生物化学]
  • 作者机构:[1]西南大学食品科学学院,重庆400715, [2]湖南农业大学园艺园林学院,湖南长沙410128, [3]重庆市农产品加工技术重点实验室,重庆400715
  • 相关基金:国家“863”计划项目(2011AA100805); 新疆生产建设兵团博士基金项目(2009JC12); 国家自然科学基金项目(31071826)
  • 相关项目:DREB和XET基因聚合表达调控月季耐寒和生长的分子基础
中文摘要:

为获得高质量肠道细菌总DNA用于研究膳食纤维对大鼠肠道菌群的影响,本实验以SD大鼠为实验动物,灌胃番茄皮膳食纤维,收集大鼠粪便及盲肠,-70℃冰箱保存。分别采用Tiangen细菌基因组试剂盒法、蛋白酶K-十六烷基三甲基溴化铵(CTAB)法和溶菌酶法提取粪便和肠道中的细菌总DNA,通过琼脂糖凝胶电泳、细菌通用引物PCR扩增和变性梯度凝胶电泳(DGGE)对提取效果进行观察比较,发现将溶菌酶法进行改进后,可以获得满意效果。改进后的溶菌酶法与另外两种方法比较,具有成本低、时间短、DNA得率高和多样性好等特点;该方法获得的DNA样品适合于用DGGE技术分析大鼠粪便及肠道菌群。

英文摘要:

In this study,SD rats were fed dietary fiber from tomato skin for understanding the effect of dietary fiber on intestinal flora.The feces and cecum of rats were collected and stored at-70 ℃.Bacterial genomic DNA was extracted from feces and cecum using TIANamp bacterial DNA kit,proteinase K-CTAB(cetyltrimethylammonium bromide) and muramidase protocol,respectively.The extracted DNA was assayed by agarose gel electrophoresis,bacterial universal primer PCR and denaturing gradient gel electrophoresis(DGGE).Results showed that more and better DNA was extracted by using modified muramidase method with lower cost and shorter extraction time when compared with other methods.Therefore,the modified muramidase protocol is the best for DNA extraction from feces and cecum of rats.

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期刊信息
  • 《食品科学》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中国商业联合会
  • 主办单位:北京市食品研究所
  • 主编:孙勇
  • 地址:北京西城区禄长街头条4号
  • 邮编:100050
  • 邮箱:foodsci@126.com
  • 电话:010-83155446-8006
  • 国际标准刊号:ISSN:1002-6630
  • 国内统一刊号:ISSN:11-2206/TS
  • 邮发代号:2-439
  • 获奖情况:
  • 国家“双效”期刊,1986年原商业部重大成果三等奖,1997年国内贸易部优秀科技期刊三等奖,第三届中国出版政府奖提名奖,第三届中国出版政府奖提名奖
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),美国工程索引,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),英国英国皇家化学学会文摘,英国食品科技文摘,中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:115579