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刺参Y-box基因的克隆与表达分析
  • ISSN号:2095-1388
  • 期刊名称:大连海洋大学学报
  • 时间:2013
  • 页码:535-541
  • 分类:S917.4[农业科学—水产科学]
  • 作者机构:大连海洋大学农业部北方海水增养殖重点开放实验室, 连云港市海洋与水产科学研究所, 连云港市海珍品增养殖试验场
  • 相关基金:国家自然科学基金资助项目(41106128);国家“863”计划重大项目(2012AA10A412);江苏省科技支撑计划项目(BE2012421)
  • 相关项目:刺参盐度调控基因的筛选及功能验证
中文摘要:

为了探究Y-box基因在刺参Apostichopus japonicus胚胎发育及性别分化中的作用,根据已有的EST序列,通过RACE技术克隆了刺参Y-box基因的cDNA全长序列,并利用实时定量PCR技术进行了表达模式分析。结果表明:刺参Y-box基因cDNA全长为1 142 bp,5’端UTR为102 bp,3’端UTR为215 bp,开放阅读框(ORF)为825 bp;Y-box基因cDNA全长编码274个氨基酸的前体蛋白,预测蛋白的相对分子质量为31 100,理论等电点为9.46,是亲水性蛋白;刺参Y-box氨基酸序列包含氨基酸N末端结构域、C末端结构域和冷休克结构域(CSD),其中CSD区在Y-box结合蛋白家族中非常保守;刺参Y-box结合蛋白质的二级结构没有α-螺旋和β-折叠,无规则卷曲占87.23%,延伸链占12.77%;刺参与其他物种的Ybox氨基酸的相似度为27%~41%,在冷休克区相似度很高,达到75%以上;构建的系统进化树表明,刺参与加州海兔Aplysia californica、栉孔扇贝Chlamys farreri、玻璃海鞘Ciona intestinalis聚为一支,为海洋无脊椎动物;经实时定量PCR检测,Y-box基因在小耳幼体中表达水平最高,且显著高于其他各发育阶段(P【0.05),在雄性性腺中的表达量显著高于雌性性腺(P【0.05)。研究表明,Y-box基因在刺参的胚胎发育及性别分化中发挥重要作用。

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期刊信息
  • 《大连海洋大学学报》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:辽宁省教育厅
  • 主办单位:大连海洋大学
  • 主编:姚杰
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  • 邮箱:xuebao@dlou.edu.cn
  • 电话:0411-84762672
  • 国际标准刊号:ISSN:2095-1388
  • 国内统一刊号:ISSN:21-1575/S
  • 邮发代号:
  • 获奖情况:
  • 1995年全国高等学校自然科学学报系统优秀学报评比...,1995年全国高等农业院校学报“三优”评比一等奖,1998年全国优秀高校自然科学学报及教育部优秀科技...
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,美国剑桥科学文摘,英国动物学记录,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:1605