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EGLN1基因6个单核苷酸多态性与高海拔低氧适应的相关性
  • ISSN号:0253-9772
  • 期刊名称:《遗传》
  • 时间:0
  • 分类:Q987[生物学—遗传学;生物学—人类学]
  • 作者机构:[1]中国医学科学院北京协和医学院医学生物学研究所,昆明650118
  • 相关基金:国家高技术研究发展计划(863计划)项目; 国家自然科学基金面上项目(编号:2012AA021802)(编号:30971578)资助
中文摘要:

为了研究脯氨酰羟化酶2(EGLN1或PHD2)基因5′UTR区和内含子区的单核苷酸多态性(SNP)与高海拔低氧适应的相关性,文章使用Sequenom MassArray基因分型系统对152例西藏藏族(海拔3 650 m)和192例湖北汉族(海拔500 m)EGLN1基因的6个单核苷酸多态性位点(rs2066140、rs2808584、rs2491405、rs2486741、rs2486734和rs21533646)进行基因分型,并进行单倍型构建和分析。结果发现:6个SNP位点的纯合子基因型在高海拔和低海拔群体间均具有统计学差异(P〈0.05)。单倍型分析显示,单倍型G-G(rs2066140和rs2808584)和G-C(rs2486741和rs2486734)的频率在高海拔群体中高于低海拔群体(P〈0.05),单倍型C-A(rs2066140和rs2808584)和C-T(rs2486741和rs2486734)的频率在高海拔群体中低于低海拔群体(P〈0.05)。研究结果提示,EGLN1基因6个SNP位点的纯合子基因型和所构建的单倍型与高海拔低氧适应相关。

英文摘要:

To investigate the association between SNPs located in 5'UTR and intron of prolyl hydroxylase 2 (EGLN1 or PHD2) and adaptation to high-altitude hypoxia, the SNPs (rs2066140, rs2808584, rs2491405, rs2486741, rs2486734 and rs21533646) of EGLN1 gene were genotyped using S equenom MassArray genotyping system in 152 unrelated healthy Tibetan individuals (3 650 m altitude) and 192 Han (5 00 m altitude), and the haplotypes of these SNPs were constructed and analyzed. Our results showed all the homozygous genotypes of six SNPs loci were significantly different between the two groups (P〈0.05). The frequencies of haplotypes G-G (rs2066140 and rs2808584) and G-C (rs2486741 and rs2486734) of high-altitude group were significantly different from low-altitude group (P〈0.05). In addition, the frequencies of haplotypes C-A (rs2066140 and rs2808584) and C-T (rs2486741 and rs2486734) of high-altitude group were significantly lower than those in low-altitude group (P〈0.05). Our results indicate that the polymorphism of homozygous genotype in six SNPs and their haplotypes were associated with adaptation to high-altitude hypoxia.

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期刊信息
  • 《遗传》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中国科学院
  • 主办单位:中国遗传学会
  • 主编:张永清
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  • 邮编:100101
  • 邮箱:yczz@genetics.ac.cn
  • 电话:010-64807669
  • 国际标准刊号:ISSN:0253-9772
  • 国内统一刊号:ISSN:11-1913/R
  • 邮发代号:2-810
  • 获奖情况:
  • 中国自然科学核心期刊,《CAJ-CD》执行优秀奖,2008年12月获“中国精品科技期刊”证书和北京市印...
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,荷兰文摘与引文数据库,美国生物医学检索系统,美国生物科学数据库,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:23270