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糖蛋白质组学中基于化学反应的富集方法研究进展
  • ISSN号:1000-8713
  • 期刊名称:《色谱》
  • 时间:0
  • 分类:O658[理学—分析化学;理学—化学]
  • 作者机构:复旦大学化学系、生物医学研究院和老年医学研究中心,上海200433
  • 相关基金:国家重点研发项目(2016YFA0501303); 国家自然科学基金(20905014,21335002); 上海市自然科学基金(14ZR1403600); 上海市老年医学临床重点实验室建设项目(13dz2260700)
中文摘要:

蛋白质糖基化是一种广泛存在的重要的蛋白质翻译后修饰,糖基化肽在总酶解肽中占的比例不超过5%,这使得糖肽的分离富集成为糖蛋白质组学研究发展的关键技术之一。在诸多糖蛋白质组富集技术中,化学方法是富集技术的主导,本文从化学反应的角度介绍糖基化蛋白质富集的技术进展。富集过程按照连接和释放分别讨论,在连接过程中,重点介绍硼酸化学法、肼化学法、胺化学法和肟点击法;在释放过程中,以N-糖蛋白的酶释放法和O-糖蛋白的β-消除法为主导,一并介绍了最新的氧化断裂释放的化学法。最后,讨论总体富集策略的发展现状。该文以糖蛋白富集的共价反应为核心,分析不同方法的优缺点以及各技术在糖蛋白质组学研究中的应用和贡献。

英文摘要:

Protein glycosylation is one of the most common and important post-translational modifications (PTMs) in mammalian cells. Glycopeptides usually exist at relatively low abundance (less than 5%) compared with non-glycosylated peptides. So,enrichment approaches are important for the analysis of glycoproteome. Approaches based on chemical reactions are the main trend,here we discuss them from chemical viewpoint. There are two main processes for enrichment of glycoproteins,glycoprotein conjugation and the release from solid phase. In con-jugation process,we introduce four types of chemical reactions : one is boronic acid chemistry based on reaction between boronic acid and cisdiol groups on free glycans, and the other three are covalent reactions between aldehyde groups and functionalized groups, hydrazide for hydrazone ligation,alkylamine for reductive amination,aniline for nonreductive amination and aminooxy group for oxime click chemistry. In release process,N-glycosidase (PNGase) F for N-glycosylated proteins,β-elimination reaction for O -glycosylated proteins and a bleach method published recently are introduced,and the oxidative releasing of natural glycans is also introduced here. In addition,analysis strategies for N-/O -glycoproteins are discussed,including detection in glycoproteins and site-specific glycan occupancies. This review mainly focuses on the currently available chemical approaches based on covalent reactions for enrichment of gly- coproteins,as well as new materials derivatized with different functional groups. We compare the advantages and disadvantages of different methods and try to evaluate the contribution and future trend based on authors viewpoint.

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期刊信息
  • 《色谱》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中国科学技术协会
  • 主办单位:中国化学会 中国科学院大连化学物理研究所
  • 主编:张玉奎
  • 地址:大连市中山路457号
  • 邮编:116023
  • 邮箱:sepu@dicp.ac.cn
  • 电话:0411-84379021
  • 国际标准刊号:ISSN:1000-8713
  • 国内统一刊号:ISSN:21-1185/O6
  • 邮发代号:8-43
  • 获奖情况:
  • 1998年获中国科学院科学出版基金择优支持(1998-2...,2001年获第四届中国科学院优秀期刊二等奖,2002年获第三届中国科协优秀期刊三等奖,连续多年被评为辽宁省一级期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),波兰哥白尼索引,荷兰文摘与引文数据库,美国生物医学检索系统,美国剑桥科学文摘,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),英国英国皇家化学学会文摘,中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:26730