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黄瓜23对高多态性SSR标记的筛选与评价
  • ISSN号:0513-353X
  • 期刊名称:园艺学报
  • 时间:0
  • 页码:2140-2148
  • 分类:S642.2[农业科学—蔬菜学;农业科学—园艺学]
  • 作者机构:[1]中国农业科学院蔬菜花卉研究所,北京100081
  • 相关基金:农业部‘948’项目(2008-Z42); 国家自然科学基金项目(30972011); 国家‘863’计划项目(2010AA10A108)
  • 相关项目:黄瓜野生变种和栽培变种的全基因组遗传多样性挖掘
中文摘要:

目前在黄瓜种质研究中仍然缺乏可用的引物。利用黄瓜基因组连锁遗传图谱开发的995对备选SSR引物,挑出在7条染色体上均匀分布且能扩增出清晰稳定单一条带的多态性引物23对,并利用这些引物对黄瓜种质遗传多样性进行了探讨。通过来自不同国家和地区的30份代表性黄瓜种质资源进行SSR扩增分析,从中能够得到153条多态性条带。不同引物分析得到的种质遗传多样性差异较大,供试种质间平均期望杂合度为0.57,平均PIC值(多态性信息量)为0.60。23对引物可以清晰检测出亚洲、欧美和印度群体遗传多样性,较客观地反映了群体结构和地域性差异等信息。

英文摘要:

At present,useful primers in the study of cucumber germplasm are scarce,in this study, 23 SSR primers are selected from the 995 primers of cucumber genome linkage map,the 23 SSR primers distribute on the linkage map uniformly and can amplify clear,stable and single bands,using these markers,the genetic diversity of 30 cucumber(Cucumis sativus L.)accessions from different countries or regions was detected,and 153 polymorphism bands were got. Genetic diversity differs among 23 primers. The expected heterozygosity of detected resources is 0.57,and the average of PIC(Polymorphism information content)value is 0.60. The results distinctly prove the genetic diversity among Asian, European and India resources by 23 primers and objectively reflect information including population structure and regional differences.

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期刊信息
  • 《园艺学报》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中国科协
  • 主办单位:中国园艺学会
  • 主编:杜永臣
  • 地址:北京市中关村南大街12号
  • 邮编:100081
  • 邮箱:ivfyyxb@mail.caas.net.cn
  • 电话:010-68919523
  • 国际标准刊号:ISSN:0513-353X
  • 国内统一刊号:ISSN:11-1924/S
  • 邮发代号:82-471
  • 获奖情况:
  • 第一届全国优秀期刊奖,中国科协第三届优秀期刊奖,第二届国家期刊奖提名奖,中国期刊方阵“双效”期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:43371