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典型水稻土微生物RNA的提取方法比较
  • ISSN号:0250-3301
  • 期刊名称:环境科学
  • 时间:0
  • 页码:1066-1071
  • 语言:中文
  • 分类:X172[环境科学与工程—环境科学]
  • 作者机构:[1]中国科学院亚热带农业生态研究所亚热带农业生态过程重点实验室,长沙410125, [2]中国科学院研究生院,北京100049
  • 相关基金:国家自然科学基金项目(40771115); 中国科学院百人计划项目(KZCX2-YW-BR-01); “十一五”国家科技支撑计划项目(2008BADA7B07)
  • 相关项目:水稻土反硝化功能微生物种群演变及反硝化基因表达与N2O释放的耦合机理
中文摘要:

采用4种方法分别提取和纯化2种典型土壤微生物RNA(水稻土和旱地土),并对RNA产量和质量进行比较评价.结果表明,方法1用液氮研磨法提取的RNA提取量最高,但需要纯化后才能满足RT-PCR等后续分子生物学要求;方法2用玻璃珠破碎法提取的RNA提取量稍低,但RNA纯度较高,可以直接用于RT-PCR等后续实验;方法3用试剂盒提取的RNA纯度高,但提取量最低,成本高,且对土壤样品有选择性;方法4未能提出供试土壤的微生物RNA.选择RNA提取效果较好的方法1和方法2并应用于3种典型水稻土(紫潮泥、红黄泥、麻沙泥),结果表明,这2种方法也适合于这3种水稻土微生物RNA的提取.

英文摘要:

Four different methods were evaluated for extracting RNA from microorganisms of a paddy soil and a upland soil,the RNA quality and quantity were examined. The results showed that method 1 applying liquid nitrogen for grinding gave the highest yield but poor purity,and the additional purification was necessary for further RT-PCR. Method 2 using bead beating yielded the RNA with high purity which could be directly used for RT-PCR,but the RNA yield was lower than that of method 1. Method 3 with the commercial soil RNA extraction kit achieved high quality RNA but the lowest yield and had selectivity for soils. Method 4 is not suitable for extracting RNA from the test soils. Method 1 and method 2 with good performances on soil RNA extraction were applied to other three typical paddy soils including purple calcareous clayey soil,reddish yellow loamy soil,granitic sandy soil. The results showed that method 1 and method 2 were suitable for extracting high quality RNA from these samples,so they might be the effective methods of RNA extraction for paddy soils.

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期刊信息
  • 《环境科学》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中国科学院
  • 主办单位:中国科学院生态环境研究中心
  • 主编:赵进才
  • 地址:北京市2871信箱(海淀区双清路18号)
  • 邮编:100085
  • 邮箱:hjkx@rcees.ac.cn
  • 电话:010-62941102 62849343
  • 国际标准刊号:ISSN:0250-3301
  • 国内统一刊号:ISSN:11-1895/X
  • 邮发代号:2-821
  • 获奖情况:
  • 在全国第一届和第二届优秀科技期刊评比中分别荣获...,二次荣获中国科学院优秀期刊评比一等奖,荣获中国期刊方阵双奖期刊荣誉
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),荷兰文摘与引文数据库,美国工程索引,美国生物医学检索系统,美国剑桥科学文摘,美国生物科学数据库,英国动物学记录,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:69962