位置:成果数据库 > 期刊 > 期刊详情页
核小体定位模式及其与DNA甲基化位点分布的关系
  • ISSN号:1007-7626
  • 期刊名称:《中国生物化学与分子生物学报》
  • 时间:0
  • 分类:Q61[生物学—生物物理学]
  • 作者机构:[1]东南大学生物电子学国家重点实验室,南京210096
  • 相关基金:国家自然科学基金(No.30800209 61073141); 江苏省自然科学基金(No.SBK2010406)资助
中文摘要:

核小体定位是指DNA双螺旋相对于组蛋白八联体的位置.核小体定位通过限制蛋白结合位点参与基因转录调控.本文利用实验检测的人类CD4+T细胞核小体定位数据,研究了核小体定位在转录因子结合位点(TFBS)和转录起始位点(TSS)附近的分布模式,并分析了在TFBS和TSS周围,核小体定位与DNA甲基化之间的关系.结果表明,在休眠和激活的人类CD4+T细胞中,部分TFBS和TSS周围的核小体定位在动态改变,即在定位和缺失两种状态之间切换.在TFBS周围,核小体定位和DNA甲基化存在一种互补模式,核小体定位与DNA低甲基化相联系;而在TSS周围,两者呈现同步模式,DNA高甲基化伴随高核小体水平.而且,在TFBS和TSS周围,DNA甲基化位点的分布呈周期模式.CD4+T细胞被激活时,较少的转录因子启动了较多的基因.

英文摘要:

Nucleosome positioning refers to the position of a DNA helix with respect to the histone core.Positioning plays roles in gene transcription regulation by limiting the accessibility of DNA sequences.Using experimentally-determined nucleosome data,patterns of nucleosomes in the vicinity of transcription start sites(TSS) and transcription factor binding sites(TFBS) are investigated in CD4 + T cell.And the relationship between DNA methylation and nucleosome positioning is also studied.The results indicate that the nucleosomes around some TSS and TFBS switch dynamically in resting and activated T cells.The nucleosome distribution and DNA methylation site distribution show an anticlastic mode near TFBS.Namely,the low DNA methylation is associated with the high nucleosome level.However,in the vicinity of TSS,the two distributions show a synchronous mode.Moreover,around TFBS and TSS,a periodical feature is observed.In activation of CD4 + T cell,less transcription factors regulate more genes.

同期刊论文项目
期刊论文 23 会议论文 3
同项目期刊论文
期刊信息
  • 《中国生物化学与分子生物学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中国科学技术协会
  • 主办单位:中国生物化学与分子生物学会 北京大学
  • 主编:周春燕
  • 地址:北京市学院路38号北京大学医学部
  • 邮编:100083
  • 邮箱:shxb@bjmu.edu.cn
  • 电话:010-82801416
  • 国际标准刊号:ISSN:1007-7626
  • 国内统一刊号:ISSN:11-3870/Q
  • 邮发代号:82-312
  • 获奖情况:
  • 被美国《CA》列入世界引用频次最高的《千种表》
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),美国生物科学数据库,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:9731