位置:成果数据库 > 期刊 > 期刊详情页
马铃薯抗晚疫病基因Rpi-blb2的LRR区域多态性及分子进化分析
  • ISSN号:0253-9772
  • 期刊名称:《遗传》
  • 时间:0
  • 分类:S435.121.4[农业科学—农业昆虫与害虫防治;农业科学—植物保护]
  • 作者机构:[1]南京大学生命科学学院,医药生物技术国家重点实验室,南京210093
  • 相关基金:教育部“创新团队”项目(编号:IRT1020)资助
中文摘要:

马铃薯抗晚疫病基因Rpi-blb2是来源于马铃薯野生种Solanum bulbocastanum中的一个具有广谱抗性的NBS-LRR类抗病基因。文章用PCR的方法从20个高抗晚疫病的马铃薯栽培种和20个高感晚疫病的马铃薯栽培种以及7个马铃薯野生种中克隆了Rpi-blb2基因的LRR区段。采用生物信息学方法对这些序列的相似性、多态性位点、核酸多样性指数等参数进行了分析,发现Rpi-blb2的LRR区域在核酸水平上变异程度很高,而且存在多处热点突变位点;通过对该区域的Ka/Ks值进行估算,发现Rpi-blb2的LRR区域总体上受到纯化选择,功能保守,但是LRR区域的不同部位所受到的选择压力却不尽相同。同时,从核酸水平来看,Rpi-blb2基因的LRR区域在马铃薯栽培种和马铃薯野生种之间没有发现明显的分化。

英文摘要:

Rpi-blb2,which is originally derived from Solanum bulbocastanum,is a broad-spectrum potato late blight resistance gene and belongs to the NBS-LRR family.Here,the LRR homologues of Rpi-blb2 were cloned with PCR method from 40 potato cultivars(including 20 resistant potato cultivars and 20 susceptible ones) and 7 wild potato populations.Then,the similarities of the sequences,polymorphic(segregating) sites,and nucleotide diversities were estimated by bioinformatic methods.The results showed that high nucleotide polymorphism and some hot-spot mutations existed in the LRR region of Rpi-blb2.The test of Ka/Ks ratio showed that the function of LRR was conserved because of the purifying selection,although different positions of the Rpi-blb2 LRR region were under different selection pressures.Moreover,the LRR region of Rpi-blb2 had no clear differentiation between the cultivated and wild potatoes.

同期刊论文项目
同项目期刊论文
期刊信息
  • 《遗传》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中国科学院
  • 主办单位:中国遗传学会
  • 主编:张永清
  • 地址:北京朝阳区北辰西路1号院中国科学院遗传发育所
  • 邮编:100101
  • 邮箱:yczz@genetics.ac.cn
  • 电话:010-64807669
  • 国际标准刊号:ISSN:0253-9772
  • 国内统一刊号:ISSN:11-1913/R
  • 邮发代号:2-810
  • 获奖情况:
  • 中国自然科学核心期刊,《CAJ-CD》执行优秀奖,2008年12月获“中国精品科技期刊”证书和北京市印...
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,荷兰文摘与引文数据库,美国生物医学检索系统,美国生物科学数据库,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:23270