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紫草LePS-2基因启动子的克隆及序列分析
  • ISSN号:1672-0482
  • 期刊名称:南京中医药大学学报
  • 时间:2012
  • 页码:245-248
  • 分类:Q785[生物学—分子生物学]
  • 作者机构:[1]南京大学生命科学学院医药生物技术国家重点实验室,南京大学-南京林业大学植物分子生物学联合研究所,江苏南京210093
  • 相关基金:国家自然科学基金(31071082 31171161 31170275); 教育部创新团队项目(IRT1020);教育部“新世纪优秀人才支持计划”项目(NECT-11-0234); 江苏省自然科学基金(BK2010053 BK2011414)
  • 相关项目:紫草细胞中乙烯对光信号的响应及其对次生代谢的调控研究
中文摘要:

目的克隆紫草LePS-2基因的启动子,分析该启动子的调控元件,为研究LePS-2基因的表达调控机制奠定基础。方法以紫草愈伤组织基因组DNA为模板,利用Genome walking技术扩增LePS-2基因上游启动子序列,将序列提交至PLACE网站对该启动子进行调控元件预测。结果获得LePS-2基因启动子区域序列1164bp,PLACE软件分析表明,该启动子中存在根特异性元件、暗诱导性元件、激素应答与调节相关元件以及一些转录因子结合位点等。结论启动子元件ATATT和YTCANTYY可能分别赋予LePS-2表达的根特异性和暗诱导性;另外在LePS-2基因启动区域还发现MJ应答元件TGACG,表明MJ有可能参与对LePS-2的表达调控。

英文摘要:

OBJECTIVE To clone the promoter of LePS-2 gene of Lithospermum erythrorhizon,and to analyze its mechanism of the expression regulation.METHODS 1164bp of LePS-2 promoter fragment was amplified from Lithospermum callus genomic DNA by using Genome Walking method,which was then submitted to the PLACE website for regulatory element predict.RESULTS 1164bp of LePS-2 promoter fragment was obtained;and several important cis-acting elements,including root organ-specific elements,dark-induced elements,regulatory elements for hormones as well as some transcription factor binding sites were recognized by PLACE program.CONCLUSION Motif-ATATT and motif-YTCANTYY may respectively confer root-specific expression and dark-induced pattern of LePS-2.Furthermore,a MJ response element "TGACG" was found in the promoter region,which shows that MJ may participate in regulating LePS-2 gene expression.

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期刊信息
  • 《南京中医药大学学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:江苏省教育厅
  • 主办单位:南京中医药大学
  • 主编:范欣生
  • 地址:南京市仙林大学城仙林大道138号
  • 邮编:210023
  • 邮箱:
  • 电话:025-85711934 85811935
  • 国际标准刊号:ISSN:1672-0482
  • 国内统一刊号:ISSN:32-1247/R
  • 邮发代号:28-232
  • 获奖情况:
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,波兰哥白尼索引,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:18464