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贝叶斯网潜变量模型在抑郁患者单核苷酸多态性(SNPs)研究中的应用
  • ISSN号:1002-3674
  • 期刊名称:《中国卫生统计》
  • 时间:0
  • 分类:R394[医药卫生—医学遗传学;医药卫生—基础医学]
  • 作者机构:[1]山西医科大学公共卫生学院,030001, [2]山西医科大学第一医院
  • 相关基金:国家自然科学基金资助项目(31071156,30972553)
中文摘要:

目的采用基于贝叶斯(Bayesian)网络的潜类模型进行高维度SNPs数据的分析,为复杂性状疾病遗传以及基因定位等方面的研究提供新的方法支持。方法采用Bayesian网络潜类模型对一组抑郁障碍性疾病的单核苷酸多态性SNPs检测数据进行分析,每个研究对象分别测量7个SNP,一共检测了801个个体。结果按照累计信息贡献率达到95%的原则,应用贝叶斯网络潜变量模型选出rsll568817和rsl30058两个SNPs位点将研究对象分为2个潜在类别,各类别的概率分别为0.216和0.784,其中一类倾向于杂合子,一类倾向于纯合子。结论两个类别人群不同特征正是由于分类和解释两个类别的SNPs造成的,从而为进一步的研究SNPs是否为可疑致病位点提供依据。

英文摘要:

Objective To use latent class model based on bayesian network to analyse the high-dimensional SNPs data, providing new methodology to the study of heredity and gene location of complex traints diseases. Methods Using latent class model based on bayesian network to analyse single nucleotide polymorphism data of depressive disorders. Each individual detect 7 SNPs and the total respondents is 807. Results According to the principle of accumulation information contribution rate reaching to 95% ,the model selects rs11568817 and rs130058. Individuals is divided into 2 latent classes and the probability of the 2 classes is 0. 216 and 0. 784. One class is inclined to heterozygote, the other is inclined to he- mozygote. Conclusion This difference is caused by the SNPs which are used to classify and interpreted the classes. So we have reasons to consider these SNPs are suspicious disease locus, which provide clear idea to the next researchl

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期刊信息
  • 《中国卫生统计》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中华人民共和国卫生和计划生育委员会
  • 主办单位:中国卫生信息学会 中国医科大学
  • 主编:孟群
  • 地址:沈阳市沈北新区蒲河路77号
  • 邮编:110122
  • 邮箱:zgwstj@126.com
  • 电话:024-31939626
  • 国际标准刊号:ISSN:1002-3674
  • 国内统一刊号:ISSN:21-1153/R
  • 邮发代号:8-39
  • 获奖情况:
  • 国内外数据库收录:
  • 日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:20780