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东方粘虫U6启动子的克隆及功能验证
  • ISSN号:1004-1389
  • 期刊名称:《西北农业学报》
  • 时间:0
  • 分类:Q789[生物学—分子生物学]
  • 作者机构:西北农林科技大学植物保护学院农药研究所,陕西杨凌712100
  • 相关基金:国家自然科学基金(31371958)
中文摘要:

为了持续获得大量短片段干扰RNA(short interference RNA,siRNA),通过染色体步移技术克隆得到东方粘虫U6snRNA基因5′-端侧翼启动子序列1 426bp。经生物信息学分析,该序列含SPH元件、八聚体序列(OCT)、远端序列元件(DSE)、近端序列元件(PSE)及TATA box等RNA聚合酶Ⅲ(RNA polymeraseⅢ,RNA PolⅢ)U6启动子的特征元件。通过构建RNA干扰(RNA interference,RNAi)载体的方式,对增强型绿色荧光蛋白EGFP基因进行RNAi,证明克隆得到的东方粘虫U6启动子可成功驱动shEGFP表达,具有U6启动子功能。为后续构建以东方粘虫V-ATP酶H亚基为靶基因的沉默载体奠定基础。

英文摘要:

In order to obtain constantly short interference RNA(siRNA),the 1 426 bp 5′-flanking promoter sequence of U6 snRNA gene of Mythimna separata(Walker)was cloned by the method of Genome Walking,as well as its function was verified in this study.Based on bioinformatics analysis,the results showed that the promoter fragment contained polymeraseⅢcore promoter elements SPH,OCT,DSE,PSE and TATA box.The observation of expression level enhanced green fluorescent protein EGFP after being transfected with RNA interference(RNA interference,RNAi),the vectors by fluorescence microscope showed that the U6 promoter fragment drived the expression of shEGFP successfully.This study had established a foundation for further construction of RNAi vectors which can silence V-ATPase subunit H.

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期刊信息
  • 《西北农业学报》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中华人民共和国教育部
  • 主办单位:西北农林科技大学 甘肃、宁夏、青海、新疆农(林)业科学院 青海、新疆畜牧(兽医)科学院及新疆农垦科学院
  • 主编:廖允成
  • 地址:陕西杨凌邰城路3号西北农林科技大学西林校区大铁10号信箱
  • 邮编:712100
  • 邮箱:xbnx@chinajournal.net.cn
  • 电话:029-87082760 87082010
  • 国际标准刊号:ISSN:1004-1389
  • 国内统一刊号:ISSN:61-1220/S
  • 邮发代号:52-111
  • 获奖情况:
  • 教育部科技司颁发的"优秀科技期刊二等奖"等
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:27312