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Comparisons of extraction and purification methods of soil microorganism DNA from rhizosphere soil
  • ISSN号:1007-662X
  • 期刊名称:《林业研究:英文版》
  • 时间:0
  • 分类:S154.3[农业科学—土壤学;农业科学—农业基础科学]
  • 作者机构:[1]Environmental Science and Engineering College, Chang'an University, Xi'an 710054, P. R, China, [2]Institute of Applied Ecology of the Chinese Academy of Sciences, Shenyang 110016, P. R. China, [3]College of Earth Science and Land Resource Management, Chang'an University, Xi'an 710054, P. R. China
  • 相关基金:This project was supported by the Knowledge Innovation Project from Chinese Academy (KZCXI-SW-01) and the National Natural Science Foundation of China (30070158).
中文摘要:

从 Pinus koraiensis 和 Pinussylvestriformis 的根围土壤的微生物脱氧核糖核酸被朊酶 K 基于 SDS 方法, CTAB 方法, PVP ( polyvinylpolypyrrolidone )方法,和结冰并且融化的方法提取,从根围土壤的粗略的脱氧核糖核酸被分离方法净化,银祷告吸收方法,并且挤压 DNAgel 方法。方法的不同提取并且净化的结果被比较并且评估。结果显示为在根围的微生物脱氧核糖核酸的抽取的最好的方法与 1.0% 的高盐集中(w/v ) 基于 SDS 方法玷污 wasproteinse K NaCl,它能有效地消除胡敏酸和其它杂质。因为有效地移开棕色的事和胡敏酸,分离方法对从根围土壤的 purifyDNA 合适,净化的产品被适合到 PCR 扩大。挤压脱氧核糖核酸胶化方法也是有优点的一个好纯化方法在费用便宜、在使用有效。

英文摘要:

Microorganism DNA of rhizosphere soil from Pinus koraiensis and Pinus sylvestriformis were extracted by proteinase K based on SDS method, CTAB method, PVP (polyvinylpolypyrrolidone) method, and freezing and thawing method and the crude DNA from rhizosphere soil were purified by dialysis method, silver beads absorption method, and squeezing DNA gel method. The results of different extracting and purifying methods were compared and evaluated. Results indicated that the best method of extraction for microorganism DNA in rhizosphere soil was proteinse K based on SDS method with high salt concentration of 1.0% (w/v) NaCl, which could effectively eliminate humic acids and other impurities. The dialysis method was suitable to purify DNA from rhizosphere soil because of effectively removing brown matters and humic acids and the purified products were suited to PCR amplification. Squeezing DNA gel method was also a good purification method with the advantage of inexpensive in cost and efficient in use.

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期刊信息
  • 《林业研究:英文版》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:教育部
  • 主办单位:东北林业大学
  • 主编:杨传平
  • 地址:哈尔滨市动力区和兴路26号
  • 邮编:150040
  • 邮箱:jfr@mail.nefu.edu.cn
  • 电话:0451-82191144 82190464
  • 国际标准刊号:ISSN:1007-662X
  • 国内统一刊号:ISSN:23-1409/S
  • 邮发代号:
  • 获奖情况:
  • 1999年黑龙江省科技期刊审读评比农、林、水、医87...,2000年黑龙江省优秀科技期刊评比中获二等奖,省科技厅,2002年黑龙江省期刊语言文字规范检查评比获一等奖...,2002年《中国学术期刊(光盘版)检索与数据规范》...,2004年获得全国优秀农业期刊学术类二等奖,中国农学会,2008年获得第二届中国高校优秀期刊奖,教育部科技司,2008年荣获第六届中国科协期刊优秀学术论文二等奖...,2009年获教育部科技论文在线优秀期刊二等奖,
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,波兰哥白尼索引,荷兰地学数据库,荷兰文摘与引文数据库,美国生物科学数据库,英国动物学记录,中国中国科技核心期刊
  • 被引量:349