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花生属人工异源多倍体进化早期基因表达变化的cDNA-SCoT分析
  • ISSN号:0496-3490
  • 期刊名称:作物学报
  • 时间:2014.7
  • 页码:1767-1775
  • 分类:Q943[生物学—植物学]
  • 作者机构:[1]广西农业科学院经济作物研究所,广西南宁530007, [2]广西大学农学院,广西南宁530004, [3]广西作物遗传改良生物技术重点开放实验室,广西南宁530007, [4]广西农业科学院,广西南宁530007
  • 相关基金:广西自然科学基金项目(2012GXNSFBA053051); 广西农业科学院科技发展基金项目(桂农科2012JM15); 国家自然科学基金项目(31160294,31240059); 广西科学研究与技术开发计划项目(桂科能14121008-1-4); 广西农业科学院基本科研业务专项项目(桂农科2014YZ05); 广西重点实验室建设项目(12-071-09)资助
  • 相关项目:龙生型花生抗青枯病及高油酸基因资源的创新利用
中文摘要:

为了探索花生属异源多倍体进化理论和种间杂交过程所涉及的遗传机制,以四倍体栽培种花生与二倍体野生种A.doigoi及其种间杂种F1和早期多倍体世代(S0~S3)为材料,采用cDNA-SCoT技术研究花生属人工异源多倍体进化早期基因表达变化规律。12条SCoT引物共扩增出108个cDNA片段,获得差异片段80个,占扩增总条带数的74.07%,对其中的35个差异片段进行克隆测序,有26个和GenBank数据库中已录入的基因具有较高的相似性,包括能量与代谢相关基因(8个)、未知功能蛋白基因(3个)、抗逆性相关基因(4个)、信号传导相关基因(2个)和反转录转座子相关基因(9个)。这说明花生属种间杂交人工异源多倍化早期世代发生着快速、剧烈的基因表达变化;从中获得的一些差异基因片段可用于花生属异源多倍化的分子机制研究。

英文摘要:

To explore the allopolyploidy evolutionism and the genetic mechanism of Arachis interspecific hybridization, study the gene expression variation by cDNA-SCoT technique in the early period of Arachis artificial allopolypoidy evolution, using the progenitors, F1 and early polyploidy generations (S0 to S3) of the hybridization between tetraploid cultivated peanut and diploid wild peanut A. doigoi. Among 108 cDNA fragments amplified by 12 SCoT primers 80 were differentially expressed with the polymorphism frequency of 74.07%. Among 80 TDFs (transcripts derived fragments) 35 were cloned and sequenced, and the sequences of 26 TDFs shared high similarity with the genes documented in the GenBank. These genes included energy and me-tabolism-related genes (8), resistance-related genes (4), unknown functional protein genes (3), signal transduction-related genes (2), and retrotransposon-related genes (9). These results indicated that gene expression changes happened rapidly and drastically in the early generations during artificial allopolyploidization of peanut interspecific hybridization, and some obtained TDFs probably could be used in the research of molecular mechanism of Arachis allopolyploidization.

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期刊信息
  • 《作物学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中国科学技术协会
  • 主办单位:中国作物学会 中国农业科学院作物科学研究所
  • 主编:万建民
  • 地址:北京海淀区中关村南大街12号中国农业科学院
  • 邮编:100081
  • 邮箱:zwxb301@caas.cn
  • 电话:010-82108548
  • 国际标准刊号:ISSN:0496-3490
  • 国内统一刊号:ISSN:11-1809/S
  • 邮发代号:82-336
  • 获奖情况:
  • 2002年-第三届中国科协优秀科技期刊二等奖,2002-2009年-百种中国杰出学术期刊,2004年获“全国优秀期刊一等奖”,2005年获第三届国家期刊奖提名奖,2009年评为“2008年度中国精品科技期刊”,2009年被评为“新中国60年有影响力的期刊”,2011年获"第二届中国出版政府奖期刊奖提名奖"
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,波兰哥白尼索引,美国剑桥科学文摘,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),英国食品科技文摘,中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:49369