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利用iCODEHOP设计简并引物克隆益生菌FGM通透酶基因片段
  • ISSN号:1671-7236
  • 期刊名称:中国畜牧兽医
  • 时间:2012.8.8
  • 页码:64-67
  • 分类:Q78[生物学—分子生物学]
  • 作者机构:[1]中国农业科学院兰州畜牧与兽药研究所,甘肃省中兽药工程技术研究中心,甘肃兰州730050
  • 相关基金:国家自然科学基金项目(31072162); 中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资金项目(1610322011007)
  • 相关项目:乳杆菌FGM9体外转化黄芪多糖的机理研究
中文摘要:

作者通过iCODEHOP在线设计细菌通透酶的简并引物,以发酵黄芪菌FGM基因组DNA为模板进行TouchdownPCR扩增,得到740 bp PCR产物,将产物经pGEM-T Easy载体连接,转化至JM109中,筛选阳性株并测序。序列通过BLAST x检索与GenBank进行同源性比对后,结果表明,此DNA产物序列与其他菌属来源的通透酶蛋白序列具有相似性,所克隆的序列即为FGM通透酶基因片段。用iCODEHOP在线设计的简并引物可信性强,阳性率高。FGM通透酶基因的成功克隆为细菌发酵黄芪机理研究提供了依据。

英文摘要:

Degenerate PCR for permease using iCODEHOP to design the degenerate primers,chosing a pair of degenerate primers and utilizing the probiotics bacteria genome DNA as template.740 bp PCR product was obtained,transformed into the E.coli JM109 through being linked with pGEM-T easy vector and sequenced after filtration.Similarity alignment showed that the products of the cloned DNA were similar to those of permease gene from the other strains.The cloned sequence was putatively permease gene DNA fragment from FGM strain.The results indicated that the degenerate primers designed by the iCODEHOP software could be used to obtain specific gene fragment.Cloning of gene fragment would give a scientific warrant for further study of the fermenting mechanism of astragalus.

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期刊论文 15 会议论文 1 获奖 2 专利 6
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期刊信息
  • 《中国畜牧兽医》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中华人民共和国农业部
  • 主办单位:中国农业科学院北京畜牧兽医研究所
  • 主编:李琍
  • 地址:中国农业科学院北京畜牧兽医研究所
  • 邮编:100193
  • 邮箱:zgxmsy@caas.cn
  • 电话:010-62816020 62811226 62810371
  • 国际标准刊号:ISSN:1671-7236
  • 国内统一刊号:ISSN:11-4843/S
  • 邮发代号:2-215
  • 获奖情况:
  • 1996年被农业部评为“95中国出版成就展”参展期刊...,1998年在首届全国畜牧兽医优秀科技期刊评比中总分...,2002年被中国期刊协会农业期刊分会和中国农学会评...
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:22619