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普通小麦TaDep1基因克隆与特异性标记开发
  • ISSN号:0496-3490
  • 期刊名称:《作物学报》
  • 时间:0
  • 分类:S511.901[农业科学—作物学]
  • 作者机构:[1]中国农业科学院作物科学研究所/国家小麦改良中心,北京100081, [2]CIMMYT中国办事处,北京100081
  • 相关基金:国家自然科学基金项目(31161140346); 引进国际先进农业科学技术计划(948计划)重大国际合作项目(2011-G3)资助
中文摘要:

OsDep1(dense and erectpanicle 1)控制水稻产量性状,影响穗长、直立性和着粒密度。根据水稻OsDep1基因序列,采用同源克隆技术克隆了普通小麦第5同源群染色体上的TaDep1基因,它包含5个外显子和4个内含子,与水稻OsDep1基因结构相似。TaDep1-A1、TaDep1-B1和TaDep1-D1的编码序列长度分别为918、888和900bp,编码305、295和299个氨基酸残基。在普通小麦品种中检测到5个TaDep1-A1等位变异、4个TaDep1-B1等位变异和2个TaDep1-D1等位变异。根据TaDep1-A1和TaDep1-B1位点不同等位变异间的SNP和InDel,开发了3对显性互补标记和1个共显性标记,可以准确鉴别不同等位基因。共显性标记dep19是根据TaDep1-B1第5外显子一个30bp的InDel开发的,可准确区分TaDep1-B1c与TaDep1-B1a、TaDep1-B1b和TaDep1-B1d。用这些标记对406份小麦品种进行检测,不同基因型的千粒重、株高、穗长、小穗数和穗节间均差异不显著,说明TaDep1基因与我国现有小麦

英文摘要:

Dense and erect panicle 1 (OsDepl) gene is an important QTL controlling yield associated traits such as panicle length, erect type, and grain density in rice. In the present study, full-length genomic DNA sequences of TaDepl on common wheat group 5 chromosomes were cloned by homologous cloning approach based on the sequences office OsDepl. TaDepl has five exons and four introns, similar to that of rice OsDepl. The coding sequences of TaDepl-A1, TaDepl-B1, and TaDepl-D1 were 918, 888, and 900 bp, encoding polypepetides of 305, 295, and 299 amino acids, respectively. Five allelic variants on TaDepl-A1 locus, four on TaDepl-B1 locus, and two on TaDepl-D1 locus were identified. Three pairs of complementary dominant markers and one codominant marker were developed based on the sequence polymorphisms presented in allelic variants of TaDepl-A1 and Ta- Depl-B1. The codominant marker depl9, which can accurately discriminate the allelic variants of TaDepl-Blc from those of Ta- Depl-Bla, TaDepl-Blb, and TaDepl-Bld, was developed from a 30 bp InDel of different allelic variants at the fifth exon of Ta- Depl-B1. No significant association was found among the yield associated traits such as thousand-kernel weight, plant height, panicle length, spikelet number and spikelet spacing in 406 cultivars, indicating that these genes have no significant effect on the yield-related traits in current Chinese wheat cultivars.

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期刊信息
  • 《作物学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中国科学技术协会
  • 主办单位:中国作物学会 中国农业科学院作物科学研究所
  • 主编:万建民
  • 地址:北京海淀区中关村南大街12号中国农业科学院
  • 邮编:100081
  • 邮箱:zwxb301@caas.cn
  • 电话:010-82108548
  • 国际标准刊号:ISSN:0496-3490
  • 国内统一刊号:ISSN:11-1809/S
  • 邮发代号:82-336
  • 获奖情况:
  • 2002年-第三届中国科协优秀科技期刊二等奖,2002-2009年-百种中国杰出学术期刊,2004年获“全国优秀期刊一等奖”,2005年获第三届国家期刊奖提名奖,2009年评为“2008年度中国精品科技期刊”,2009年被评为“新中国60年有影响力的期刊”,2011年获"第二届中国出版政府奖期刊奖提名奖"
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,波兰哥白尼索引,美国剑桥科学文摘,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),英国食品科技文摘,中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:49369