位置:成果数据库 > 期刊 > 期刊详情页
非连续分子动力学模拟方法及其在大分子研究中的应用
  • ISSN号:1008-9357
  • 期刊名称:《功能高分子学报》
  • 时间:0
  • 分类:TQ172.79[化学工程—水泥工业;化学工程—硅酸盐工业]
  • 作者机构:[1]复旦大学高分子科学系、聚合物分子工程教育部重点实验室,上海200433
  • 相关基金:国家自然科学基金(50533010和两个基地项目)
中文摘要:

计算机模拟技术已成为大分子构象等基础研究的一种重要手段。非连续分子动力学模拟(DMD)与传统的分子动力学模拟(MD)方法有所不同,基于不连续势能和相关的模拟编程方法,运行速度大大提高。本文讨论了DMD方法的特点,总结了DMD方法的应用,重点以蛋白质折叠为例介绍了如何使用DMD方法,最后对DMD方法的发展前景进行了展望。

英文摘要:

Computer simulations have become one of critical tools to study fundamental problems related to macromolecular conformations. Different from conventional molecular dynamics simulation, discontinuous molecular dynamics (DMD) simulation is based upon a discontinuous potential and unique programming skills, and thus saves computing cost greatly. This review summarizes the advantages, limitations and applications of DMD. With protein folding as an example, the review demonstrates how to use the DMD method to resolve scientific problems. Finally, a brief prospect is presented.

同期刊论文项目
期刊论文 47 会议论文 14 专利 6
同项目期刊论文
期刊信息
  • 《功能高分子学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:教育部
  • 主办单位:华东理工大学
  • 主编:林嘉平
  • 地址:上海市梅陇路130号
  • 邮编:200237
  • 邮箱:gngfzxb@ecust.edu.cn
  • 电话:021-64253005
  • 国际标准刊号:ISSN:1008-9357
  • 国内统一刊号:ISSN:31-1633/O6
  • 邮发代号:4-629
  • 获奖情况:
  • 获全国化工系统优秀期刊奖,教育部科技期刊优秀编辑质量奖
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),美国剑桥科学文摘,英国高分子图书馆,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:9584