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大豆钾转运体基因GmKT12的克隆和信息学分析
  • ISSN号:0496-3490
  • 期刊名称:《作物学报》
  • 时间:0
  • 分类:S565.1[农业科学—作物学]
  • 作者机构:[1]中国农业科学院油料作物研究所/农业部油料作物生物学重点开放实验室,湖北武汉430062, [2]中国农业科学院研究生院,北京100081, [3]南京农业大学/国家大豆改良中心/作物遗传与种质创新国家重点实验室,江苏南京210095
  • 相关基金:本研究由国家转基因生物新品种培育科技重大专项(2011ZX08004-005,2009ZX08009-133B),匡l家自然科学基金项目(30871554,30900906),中国农业科学院公益性院所科研基金(1610172011006)资助.
中文摘要:

以钾高效和钾敏感型大豆品系为试验材料,设置低钾胁迫试验,在8个时间段取样提取RNA,利用Real.timePCR检测GmKTl2基因的表达量,结果显示GmKTl2基因在不同品系地上部和地下部表达水平有显著差异,其原因来自GmKTl2基因的氨基酸序列和蛋白质结构的变异。从2个品系中分别克隆目的基因并对基因序列进行同源性及生物信息学分析表明,与GmKTl2基因相似性在30%以上的同源基因有56个,GmKTl2在进化树中的位置与Glymal8g18822最近;GmKTl2编码蛋白为可溶性跨膜蛋白,具有多个磷酸化位点,该基因与信号转导有关,对大豆获取及转运钾离子可能起着关键作用。

英文摘要:

GmKT12 predicted as a potassium transporter is of great importance in absorbing nutrients, signal transduction in plant growth. At present, there are few reports about the gene. In this paper, one low K tolerant soybean line You 06-71 and one low K intolerant line Hengchun 04-11 were used as plant materials. In order to research the expression level of GmKT12 in low potas- sium stress conditions, RNA was extracted and tested by Real-time PCR in eight periods. The results showed that there were highly significant differences between two lines due to their was diversity of amino acid sequence and protein structure. Homol- ogy and Bioinformatic analysis after cloning the target sequence from the two lines showed that comparing with GmKT12, there were 56 homologous genes with more than 30 percent similarity, GmKT12 and Glyma18g18822 were nearest in the phylogenetic tree. The protein encoded by GmKT12 was soluble transmembrane protein which contained 11-12 membrane structural domains, and possessed multiple phosphorylation sites. These indicated that the protein might take part in plant signal transduction and regulate potassium ions transportation into or out of cells. In conclusion, GmKT12 might play a pivotal role in potassium absorp- tion in soybean, on which the research is important.

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期刊信息
  • 《作物学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中国科学技术协会
  • 主办单位:中国作物学会 中国农业科学院作物科学研究所
  • 主编:万建民
  • 地址:北京海淀区中关村南大街12号中国农业科学院
  • 邮编:100081
  • 邮箱:zwxb301@caas.cn
  • 电话:010-82108548
  • 国际标准刊号:ISSN:0496-3490
  • 国内统一刊号:ISSN:11-1809/S
  • 邮发代号:82-336
  • 获奖情况:
  • 2002年-第三届中国科协优秀科技期刊二等奖,2002-2009年-百种中国杰出学术期刊,2004年获“全国优秀期刊一等奖”,2005年获第三届国家期刊奖提名奖,2009年评为“2008年度中国精品科技期刊”,2009年被评为“新中国60年有影响力的期刊”,2011年获"第二届中国出版政府奖期刊奖提名奖"
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,波兰哥白尼索引,美国剑桥科学文摘,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),英国食品科技文摘,中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:49369