位置:成果数据库 > 期刊 > 期刊详情页
籽粒苋苹果酸酶基因克隆及分析
  • ISSN号:1000-4025
  • 期刊名称:西北植物学报
  • 时间:0
  • 页码:0229-0236
  • 分类:Q943[生物学—植物学] Q785[生物学—分子生物学]
  • 作者机构:[1]山西大学生物工程学院,太原030006, [2]山西省农业科学院作物遗传研究所,太原03003I
  • 相关基金:国家自然科学基金(30971838);山西省科技攻关(20080311016);山西省回国留学人员基金(200986)
  • 相关项目:高安全性抗多种病毒的转基因马铃薯研究
中文摘要:

NAD/NADP-苹果酸酶(NAD-ME/NADP-ME)是C4植物光合途径的关键酶。采用RT-PCR技术对籽粒苋NAD-ME基因进行克隆,获得了籽粒苋NAD-ME基因的cDNA序列。结果表明,该序列开放可读框长度为1 872 bp,编码623个氨基酸;多序列比对和进化树分析表明,该基因核苷酸序列与其他植物已报道的NAD-ME/NADP-ME基因的核苷酸序列一致性高达75.1%-80.6%,其氨基酸序列与其他植物的NAD-ME/NADP-ME蛋白一致性为73.2%-80.3%。对推断氨基酸序列的蛋白保守区、疏水性/亲水性、潜在跨膜片段、信号肽、蛋白固有无序化和蛋白二级结构分析表明,该蛋白具有苹果酸酶的保守区、兼具亲水性和疏水性,并且含有无序结构域,可能是一种跨膜的非分泌性蛋白。

英文摘要:

NAD/NADP-malic enzyme is a key enzyme in C4 photosynthetic pathway.The NAD-ME gene of Amaranthus hypochondriacus was cloned by RT-PCR.According to the analysis of the sequence,the cDNA included a 1 872 bp open reading frame that encoded 623 amino acids.Multi-sequence comparisons and phylogenetic analysis showed that the nucleotide sequence had 75.1%-80.6% identity with the reported NAD-ME/NADP-ME genes of other plants,and the amino acids sequence had 73.2%-80.3% identity.Furthermore,the physico-chemical property of NAD-ME of Amaranthus hypochondriacus,including the conservative domains,hydrophobicity/hydrophilicity,potential transmembrane segments,signal peptides,intrinsically disordered structure and secondary structure of the hypothetical protein were analyzed.The results suggested that the protein contained conservative domains of NAD-ME,both hydrophobic and hydrophilic regions,and also the disordered regions.Thus it seems a non-secreted transmembrane protein.

同期刊论文项目
同项目期刊论文
期刊信息
  • 《西北植物学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中华人民共和国教育部
  • 主办单位:西北农林科技大学 陕西省植物学会
  • 主编:赵忠
  • 地址:陕西杨陵邰城路3号西北农林科技大学
  • 邮编:712100
  • 邮箱:xbzwxb@vip.163.com
  • 电话:029-87082936
  • 国际标准刊号:ISSN:1000-4025
  • 国内统一刊号:ISSN:61-1091/Q
  • 邮发代号:52-73
  • 获奖情况:
  • 全国优秀期刊,中国自然科学核心期刊,中国期刊方阵“双效”期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,美国生物科学数据库,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:46104