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小桐子转化酶基因家族的生物信息学分析及表达特性
  • ISSN号:1002-5464
  • 期刊名称:《生物技术通报》
  • 时间:0
  • 分类:S688.4[农业科学—观赏园艺;农业科学—园艺学]
  • 作者机构:曲靖师范学院云南高原生物资源保护与利用研究中心云南省高校云贵高原动植物遗传多样性及生态适应性重点实验室,曲靖655011
  • 相关基金:国家自然科学基金项目(31460179)
中文摘要:

转化酶是植物蔗糖代谢与抗逆性形成的关键酶。基于小桐子基因组数据,鉴定到16个小桐子转化酶基因,并对其系统进化、基因结构、理化性质、保守基序及表达特性进行了分析。结果表明,小桐子转化酶基因家族聚类为3个亚家族,中性/碱性转化酶α亚组与酸性转化酶基因包含6或7个外显子,β亚组包含4或5个外显子。同时,酸性转化酶N端都包含信号肽序列,且都鉴定到GH32家族保守的-NDPNG/A-与-MWECV/P-基序。qRT-PCR表达分析显示,JcC-INVD基因在小桐子子叶中表达量最高,而在根中表达量较低,且在叶中属于低温诱导基因。

英文摘要:

Plant invertase is one of critical enzymes in sucrose metabolism and stress resistance formation. The 16 invertase genes wereidentified based on complete genome data of Jatropha curcas,then the evolutionary relationship,gene structure,physical and chemicalcharacteristics,conserved motif,and expression feature were analyzed. The results showed that invertase gene family in J. curcas was clusteredto three subfamilies according to phylogenetic analysis. The α subgroup of neutral/alkaline invertases and acidic invertase gene owned 6-7exons,and β subgroup owned 4-5 exons in gene structure. Signal peptides in N-terminal and conserved motifs of-NDPNG/A-and-MWECV/Pbelonging to GH32 family were identified in acidic invertase protein sequences. q RT-PCR analysis revealed that Jc C-INVD expressed differentlyin different tissues,with abundantly in cotyledon,but scarcely in root,and remarkably cold-induced expression in leaf.

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期刊信息
  • 《生物技术通报》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中华人民共和国农业部
  • 主办单位:中国农业科学院农业信息研究所
  • 主编:孙国凤
  • 地址:北京海淀区中关村南大街12号
  • 邮编:100081
  • 邮箱:biotech@mail.caas.net.cn
  • 电话:010-82109925 82109903
  • 国际标准刊号:ISSN:1002-5464
  • 国内统一刊号:ISSN:11-2396/Q
  • 邮发代号:18-92
  • 获奖情况:
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:15544