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基于线粒体COⅠ基因鉴别云斑尖塘鳢和线纹尖塘鳢的分子标记
  • ISSN号:1674-568X
  • 期刊名称:《基因组学与应用生物学》
  • 时间:0
  • 分类:Q[生物学]
  • 作者机构:[1]南京农业大学无锡渔业学院,无锡214081, [2]中国水产科学研究院珠江水产研究所,农业部热带亚热带水产资源利用与养殖重点实验室,广州510380
  • 相关基金:科技基础性工作专项(2013FY110700)资助致谢本研究由科技基础性工作专项(2013FY110700)资助.
中文摘要:

云斑尖塘鱼鳢(Qxyleotris marmoratus)原产于泰国、越南等东南亚国家线纹尖塘鳢(Oxyeletris lineolatus)原产于澳大利亚,目前两者已成为中国的养殖品种。由于其同属塘鳢属(Oxyeleotris)形态相似,特别是在幼苗阶段难以识别,在苗种市场上常出现混淆,因此本研究研发了一种分子鉴定技术。通过对mtDNA中COⅠ(cytochrome C oxidase subunitⅠ)基因特异性位点比对和分析,设计并筛选出一对特异性引物(XW1)。特异性引物XW1可在线纹尖塘鳢中扩增获得170 by的单一产物,而在云斑尖塘鳢中无产物。通过PCR扩增产物的有无,可以区分两个物种。并在随机选择的30个样本中得到验证。本研究提供一种可以快速且不需要测序的方法来鉴别云斑尖塘鳢和线纹尖塘鳢。

英文摘要:

Marbled goby(Qxyeleotris marmoratus) is native to Southeast Asia,such as Thailand and Vietnam.The sleepy cod Oxyeleotris lineolatus is native to Queensland in northeastern of Australia.Currently,both of them are the species of aquaculture breeding in China.We found the morphology of their seedling stage is difficult to identify in seeding market.Via the alignment and analysis of CO I sequences of the Oxyeleotris marmoratus and Oxyeletris lineolatus,many primers were designed basing on the difference sites and one specific primers(XW1) were selected.Amplified with XW1,there was the 170 bp band in the Oxyeletris lineolatus,while nothing in the Oxyeleotris marmoratus.Then 30 individuals per fish were randomized to verify the primers,the results showed that the specific primers have specificity for species.The specific primers can distinguish two species simply and rapidly.This method can provide a molecular marker identification method for two species.

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期刊信息
  • 《基因组学与应用生物学》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:广西大学
  • 主办单位:广西大学
  • 主编:朱玉贤
  • 地址:广西南宁市大学东路100号广西大学西校园《基因组学与应用生物学》编辑部111室
  • 邮编:530004
  • 邮箱:gab@hibio.org 571388455@qq.com
  • 电话:0771-3239102
  • 国际标准刊号:ISSN:1674-568X
  • 国内统一刊号:ISSN:45-1369/Q
  • 邮发代号:48-213
  • 获奖情况:
  • 全国优秀高校学校自然科学学报,教育部优秀科技期刊,广西优秀科技期刊,中国期刊方阵“双效”期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,美国剑桥科学文摘,英国动物学记录,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:4299