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34株副溶血弧茵16S-23SrDNA间区多态性DGGE分析
  • ISSN号:1009-5470
  • 期刊名称:《热带海洋学报》
  • 时间:0
  • 分类:S182[农业科学—农业基础科学]
  • 作者机构:[1]中国科学院南海海洋研究所海洋生物资源可持续利用重点实验室,广东广州510301
  • 相关基金:基金项目:国家“973”计划项目(2006CB101803);国家自然科学基金(30700016)
中文摘要:

采用PCR-变性梯度凝胶电泳技术(PCR-DGGE)分析比较了34株分离于环境和水产养殖动物体内的副溶血弧菌及标准株16S-23S rDNA间区(Intergenic Spacer Region, ISR)的多态性和亲缘关系.结果表明, 34株副溶血弧菌的ISR经PCR-DGGE电泳后均能分离出4―10条条带, 共计产生15个多态性位点.所有菌株聚为H、I、J、K四大簇, 株间遗传差异最大为株A18和A25, 遗传距离达到0.4.ISR PCR-DGGE方法为副溶血弧菌基因分型提供了一种新的方法.

英文摘要:

Using PCR-denaturing gradient gel electrophoresis (PCR-DGGE), the polymorphism of 16S-23S rDNA intergenic spacer regions (ISR) from 34 Vibrio parahaemolyticus strains, including type strains and those isolated from environment and aquatic animals, were analyzed. The phylogenic relationships of these strains were also analyzed. The results showed that the ISRs could be separated into 4-10 different bands through PCR-DGGE. Thirty-four V. parahaemolyticus strains shared 15 polymorphic sites. Using MVSP, 34 strains were clustered into four groups, H, I, J, and K. Strains A18 and A25 had farthest genetic distance, with a value of 0.4. The present study suggested that ISR PCR-DGGE provided a new method for genotyping of V. parahaemolyticus.

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期刊信息
  • 《热带海洋学报》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中国科学院
  • 主办单位:中国科学院南海海洋研究所
  • 主编:张偲
  • 地址:广州市新港西路164号
  • 邮编:510301
  • 邮箱:jto@scsio.ac.cn
  • 电话:020-84459408
  • 国际标准刊号:ISSN:1009-5470
  • 国内统一刊号:ISSN:44-1500/P
  • 邮发代号:82-8
  • 获奖情况:
  • 国家“双效”期刊,1997年获评广东省优秀科技期刊一等奖,2001年进入中国期刊方阵
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),美国剑桥科学文摘,美国生物科学数据库,英国动物学记录,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:6411