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猪THRSP基因5’调控区多位点SNP联合效率的研究
  • ISSN号:1672-352X
  • 期刊名称:安徽农业大学学报
  • 时间:2014.3.30
  • 页码:278-281
  • 分类:Q75[生物学—分子生物学] S81[农业科学—畜牧学;农业科学—畜牧兽医]
  • 作者机构:[1]安徽农业大学动物科技学院,合肥230036, [2]安徽畜禽遗传资源保护与生物育种省级实验室,合肥230036
  • 相关基金:国家自然科学基金(31172180)和安徽省科技攻关项目(12010302052)共同资助.
  • 相关项目:THRSP基因变异对猪胴体脂肪沉积作用的分子机理研究
中文摘要:

旨在分析猪THRSP基因5’调控区多位点SNP联合调控THRSP基因表达的效率。实验从猪基因组获取包含多位点SNP的目的片段,利用荧光素酶报告基因pGL3-Basic构建表达载体,检测多位点SNP的联合启动效率,并通过实时荧光定量PCR进行THRSP基因表达验证分析。结果表明,在5个SNP位点中,TCAGA的启动效率最高,比CTGGA的启动效率高129%,而CCAGA、CTAGA和CTGAT的启动效率较CTGGA分别低99.0%、73.2%和42.6%。TCAGA的启动效率较CCAGA高75.6%,而CCAGA比CTAGA的启动效率高96.6%;报告基因所揭示的SNP启动效率与THRSP基因实时荧光定量PCR结果一致。

英文摘要:

This paper aims to analyze the promoter efficiency of multi-sites SNP to THRSP gene expression in the 5' regulatory region of pig THRSP gene. The fragments containing 5 SNP sites were obtained from the 5' regulatory region in pig genome. The pGL3-Basic expression vectors of luciferase reporter gene were constructed with the multi-sites SNE THRSP gene expression was detected by real-time quantitative PCR. The results showed that the TCAGA promoter efficiency in five SNP loci was highest, which increased 129% than that of CTGGA. Compared with CTGGA, the promoter efficiency of CCAGA, CTAGA and CTGAT were lower 99.0%, 73.2 % and 42.6 %, respectively. The promoter efficiency of TCAGA increased 75.6% than that of CCAGA, while CCAGA increased 96.6% than that of CTAGA. The promoter efficiency of SNP was revealed by reporter gene as the results by real-time PCR gene for THRSP gene expression

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期刊信息
  • 《安徽农业大学学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:安徽省教育厅
  • 主办单位:安徽农业大学
  • 主编:程备久
  • 地址:合肥市长江西路130号
  • 邮编:230036
  • 邮箱:ahnydxxb@mail.hf.ah.cn
  • 电话:0551-65786465
  • 国际标准刊号:ISSN:1672-352X
  • 国内统一刊号:ISSN:34-1162/S
  • 邮发代号:
  • 获奖情况:
  • 安徽省优秀科技期刊一等奖,全国优秀科技期刊三等奖,华东地区优秀期刊奖,全国优秀高校自然科学学报及教育部优秀科技期刊二等奖,安徽省优秀高校自然科学学报一等奖,全国高校优秀科技期刊一等奖,安徽省高等学校优秀学报一等奖,全国高校优秀科技期刊奖
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,美国剑桥科学文摘,英国动物学记录,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:13625