位置:成果数据库 > 期刊 > 期刊详情页
利用cDNA-AFLP技术研究副溶血弧菌感染下拟穴青蟹的基因差异表达
  • ISSN号:1000-0615
  • 期刊名称:水产学报
  • 时间:2012
  • 页码:503-508
  • 分类:Q785[生物学—分子生物学] S917.4[农业科学—水产科学]
  • 作者机构:[1]汕头大学广东省海洋生物技术重点实验室,广东汕头515063, [2]汕头大学生物系,广东汕头515063
  • 相关基金:国家自然科学基金项目(31172424); 广东高校产学研结合示范基地科技成果转化重大项目(cgzhzd0812); 广东省海洋渔业科技推广专项项目(A200905J01); 广东省教育部产学研合作专项资金项目(2007B090400049)
  • 相关项目:饲料脂肪酸对拟穴青蟹脂肪合成及其基因表达的影响
中文摘要:

研究以实验室分离自汕头牛田洋青蟹养殖区的副溶血弧菌感染的健康拟穴青蟹,利用cDNA-AFLP技术分析感染前后拟穴青蟹肝脏组织基因的转录表达差异,最终获得了23个差异片段,其中20个片段成功测序。BLAST分析表明,序列与已知功能基因具有同源性的有6个,其中5个经real-time PCR重新验证为上调表达,主要涉及参与能量代谢的精氨酸激酶(arginine kinase)和甘油醛3磷酸脱氢酶(glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase)、磷酸烯醇丙酮酸羧激酶(phosphoenolpyruvate carboxykinase),以及参与转运过程的精氨酰tRNA合成酶(arginyl-tRNA synthetase),同时,还有直接参与免疫防御反应的凝乳状蛋白酶(chymotrypsin-like proteinase)。另外,8个差异片段与已知基因或序列无同源性。

英文摘要:

Mud crab Scylla paramamosains is widely cultured in brackish and seawater ponds along the coast of southeast China including Shantou.In recent years,mud crab cultured in Niutianyang reclaiming coastal area of Shantou suffered from serious diseases,especially the bacterial diseases(such as Vibrio parahaemolyticus),which results in high mortality and great economic loss.In present study,V.parahaemolyticus isolated from Shantou Niutianyang crab culture area was injected to S.paramamosains to study the differential gene expression of the mud crab by cDNA-AFLP technology.Furthermore,20 fragments that exhibited differential expression were discovered and sequenced.The results show that 6 fragments are homologous to the known functional genes,5 of which are up-regulated.They are involved in energy metabolism including arginine kinase,phosphoenolpyruvate-carboxykinase and glyceraldehydes 3 phosphate dehydrogenase,arginyl-tRNA synthetase involved in transport progress,as well as the chymotrypsin-like proteinase involved in defense response.The other 8 fragments were identified to be unknown function genes.The result here shows that the response of S.paramamosain upon V.parahaemolyticus infection is involved in multiple pathways and needs further investigation.

同期刊论文项目
同项目期刊论文
期刊信息
  • 《水产学报》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中国科协
  • 主办单位:中国水产学会
  • 主编:黄硕琳
  • 地址:上海市军工路334号上海水产大学
  • 邮编:201306
  • 邮箱:jfc@shou.edu.cn
  • 电话:021-61900228
  • 国际标准刊号:ISSN:1000-0615
  • 国内统一刊号:ISSN:31-1283/S
  • 邮发代号:4-297
  • 获奖情况:
  • 曾先后三次获中国科协专项基金资助,获首届《CAJ-CD规范》执行优秀奖,获水产类期刊一等奖
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,美国剑桥科学文摘,英国动物学记录,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:26128