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Long interspersed elements in three species of Gracilaria (Gracilariaceae, Rhodophyta)
  • ISSN号:0254-4059
  • 期刊名称:《中国海洋湖沼学报:英文版》
  • 时间:0
  • 分类:Q176[生物学—水生生物学;生物学—普通生物学]
  • 作者机构:[1]Department of Aquaculture, Ocean University of China, Qingdao 266003, China, [2]Institute of Oceanology, Chinese Academy of Sciences, Qingdao 266071, China, [3]Graduate School of the Chinese Academy of Sciences, Beijing 100039, China
  • 相关基金:Supported by the NSFC (No. 40376049 and No. 30500383) and Shandong Agricultural Seed Stock Breeding Project and Knowledge Innovation Program of Chinese Academy of Sciences (KSCX2-YW-N-47-02).
中文摘要:

为了发现是否长散布了元素(线),存在inmacro水藻染色体,我们在代表性的家庭(种类)测试了 LINE 相当或相同事物: Gracilaria ( G.eucheumoides Harv , G tenuistipitata Chang et 夏,和 G.textorii ( Sur ) De-Toni ), Laminaria ( L.longis-sima Miyabe 和 L.japonica Aresch ),和 Ulva ( U.lactuca L.and U.pertusaKjellm )在 2004~2005 期间。聚合酶链反应(PCR ) 被执行, degenerateoligonucleotide 教材从米饭相当或相同事物的线和玉米的 Cin4 设计了。克隆并且核苷酸定序 PCR 产品表明 4 克隆源于 3 种类 ofGracilaria 那有线相当或相同事物。4 个线相当或相同事物的核苷酸序列极大地分叉,但是从他们推出的氨酸序列相对被保存。LINE 相当或相同事物的 endonucleaseregions 极大地从另外的植物的分叉,但是他们在小球藻 sp 有更近种系发生的关系到 Zepp 元素,它显示由垂直传播的那顺序分叉是对海藻的线的进化的主要影响。

英文摘要:

In order to find out whether long interspersed elements (LINEs) existed in macro-algae gehomes or not, we tested the LINE homologues in representative families (species): Gracilaria (G. eucheumoides Harv., G. tenuistipitata Chang et Xia, and G. textorii (Sur) De-Toni), Laminaria (L. longissima Miyabe and L. japonica Aresch.), and Ulva (U. lactuca L. and U. pertusa Kjellm.) during 2004 to 2005. Polymerase Chain Reaction (PCR) was carried out with degenerate oligonucleotide primers designed from LINEs of rice homologues and Cin4 of maize. Cloning and nucleotide sequencing of the PCR products revealed that 4 clones that derived from 3 species of Gracilaria have LINE homologues. The nucleotide sequences of the 4 LINE homologues diverged greatly, but the amino acid sequences deduced from them were relatively conserved. The endonuclease regions of the LINE homologues greatly diverged from that of other plants, but they had closer phylogenetic relationship to Zepp elements in Chlorella sp., which indicated that sequence divergence by vertical transmission has been a major influence on the evolution of algal LINEs.

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期刊信息
  • 《中国海洋湖沼学报:英文版》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中国科学院 中国科协
  • 主办单位:中国海洋与湖沼学会
  • 主编:曾呈奎
  • 地址:中国青岛南海路7号
  • 邮编:266071
  • 邮箱:cjol@ms.qdio.ac.cn
  • 电话:0532-82898754
  • 国际标准刊号:ISSN:0254-4059
  • 国内统一刊号:ISSN:37-1150/P
  • 邮发代号:2-581
  • 获奖情况:
  • 第一、二届全国优秀科技期刊二等奖,中科院优秀期刊二等奖
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,荷兰文摘与引文数据库,美国地质文献预评数据库,美国剑桥科学文摘,美国科学引文索引(扩展库),美国生物科学数据库,英国科学文摘数据库,英国动物学记录,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊
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