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In vitro selection of high-affinity DNA aptamers for streptavidin
  • ISSN号:1672-9145
  • 期刊名称:Acta Biochim Biophys Sin
  • 时间:0
  • 页码:335-340
  • 语言:英文
  • 分类:Q78[生物学—分子生物学] TS252.1[轻工技术与工程—农产品加工及贮藏工程;轻工技术与工程—食品科学与工程]
  • 作者机构:[1]Department of Stomatology, General Hospital of PLA, Beijing 100853, China, [2]Beijing Institute of Basic Medical Sciences, Beijing 100850, China, [3]Center of Bioscience, University of Science and Technology of China, Hefei 230027, China
  • 相关基金:Acknowledgements We thank Dr Peixuan Guo (Purdue University, West Lafayette, IN, USA) for designing the ssDNA library. We are grateful to all the members in our laboratory for their help. Funding This work was supported by the National Science Foundation of China (No. 30440059 and No. 30772426 in 2008). Natural in 2005
  • 相关项目:抑制葡聚糖介导变形链球菌粘附的ssDNA配基的筛选及其结构与功能研究
中文摘要:

在这研究,我们由指数的丰富(SELEX ) 开发了 ligands 的系统的进化用磁性的祷告固定和流动 cytometric 测量的联合的方法。作为一个例子, streptavidin 特定的 aptamers 的选择被执行。在这个协议,常规 SELEX 过程被优化,首先使用磁性的祷告让目标固定从未装订的 ssDNAs 便于有约束力的搁浅单人赛的 DNA (ssDNA ) aptamers 的高度有效的分离,并且第二使用标记监视丰富的流动 cytometry 和荧光黄。流动 cytometry 的敏感在 SELEX 过程期间为 ssDNA quantification 是足够的。当为有 biotinylated 的修改 streptavidin 的表面的占有的描述的工具指向分子,在这个工作获得的 streptavidin 特定的 aptamers 能被使用。在学习描述的方法通常也是适用的指向除 streptavidin 以外的分子。

英文摘要:

In this study, we developed a systematic evolution of ligands by exponential enrichment (SELEX) method using a combination of magnetic beads immobilization and flow cytometric measurement. As an example, the selection of streptavidin-specific aptamers was performed. In this protocol, the conventional SELEX procedure was optimized, fiirst using magnetic beads for target immobilization to facilitate highly efficient separation of the binding single-stranded DNA (ssDNA) aptamers from the unbound ssDNAs, and second using flow cytometry and fluorescein labeling to monitor the enrichment. The sensitivity of flow cytometry was adequate for ssDNA quantification during the SELEX procedures. The streptavidin-specific aptamers obtained in this work can be used as tools for characterization of the occupancy of streptavidin-modified surfaces with biotinylated target molecules. The method described in the study is also generally applicable to target molecules other than streptavidin.

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期刊信息
  • 《生物化学与生物物理学报:英文版》
  • 北大核心期刊(2004版)
  • 主管单位:
  • 主办单位:中国科学院上海生物化学研究所
  • 主编:
  • 地址:上海岳阳路319号
  • 邮编:200031
  • 邮箱:abbs@sibs.ac.cn
  • 电话:021-54920956 54920955
  • 国际标准刊号:ISSN:1672-9145
  • 国内统一刊号:ISSN:31-1940/Q
  • 邮发代号:4-210
  • 获奖情况:
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,荷兰文摘与引文数据库,美国生物医学检索系统,美国剑桥科学文摘,美国科学引文索引(扩展库),美国生物科学数据库,英国动物学记录,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),英国英国皇家化学学会文摘,中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:5851