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北京汉族群体39个短串联重复序列基因座多态性及其遗传关系
  • ISSN号:0253-9772
  • 期刊名称:《遗传》
  • 时间:0
  • 分类:Q987[生物学—遗传学;生物学—人类学]
  • 作者机构:[1]中国科学院北京基因组研究所,北京100101, [2]深圳市公安局刑事科学技术研究所,深圳518001, [3]中国科学院大学,北京100049, [4]北京市公安局法医检验鉴定中心,北京100192
  • 相关基金:国家自然科学基金项目(编号:81172909,81330073)资助
中文摘要:

本文首次对北京地区汉族人群的13个CODIS(Combined DNA index system)和26个非CODIS系统STR基因座的遗传多态性进行了研究,建立了北京地区汉族人群39个STR基因座的群体遗传多态性数据库并对其法医学应用价值进行了评价。39个STR基因座的基因型分布均符合Hardy-Weinberg平衡且各基因座之间均不存在连锁现象,个体鉴别力(Power of discrimination,DP)在0.7740-0.9818之间,期望杂合度(Expected heterozygosity,He)在0.6000-0.9350之间,多态性信息含量(Polymorphism information content,PIC)在0.5317-0.9047之间,非父排除率(Power of exclusion,PE)在0.2909-0.8673之间,累积个体鉴别力(Cumulative probability of discrimination,CDP)为0.999999999999999999999999999999999999999964971,累积非父排除率(Cumulative probability of exclusion,CPE)为0.999999999973878。另外,结合已公开报道的国内其他11个群体相应基因座的遗传资料,根据等位基因频率计算遗传距离,构建了系统发生树。本研究可为中国法医DNA数据库和群体遗传学数据库提供重要的基础数据,对北京地区汉族人群开展法医学个体识别、亲权鉴定和遗传学研究具有重要的意义。

英文摘要:

In this study, we studied the genetic polymorphisms of short tandem repeat(STR) loci from 13 CODIS and 26 non-CODIS system in Beijing Han population for the first time, and established a database of 39 STR loci whose forensic parameters were further evaluated. Our results demonstrated no significant deviation from the Hardy-Weinberg equilibrium of 39 STR loci and no pairwise linkage disequilibrium between them. The power of discriminations, expected heterozygosity, polymorphic information content, and power of exclusion of 39 STR loci ranged from 0.7740?0.9818, 0.6000?0.9350, 0.5317?0.9047 and 0.2909?0.8673. The cumulated discrimination power and cumulative probability of exclusion were 0.999999999999999999999999999999999999999964971 and 0.999999999973878, respectively. Moreover, the genetic distance was calculated based on allele frequency and phylogenetic tree was built using STR loci data from Beijing Han and other 11 Chinese ethnic groups.This study provides important basic data for Chinese forensic DNA database and population genetics database, and has important significance in carrying out forensic individual identification, paternity testing, and population genetic study.

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期刊信息
  • 《遗传》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中国科学院
  • 主办单位:中国遗传学会
  • 主编:张永清
  • 地址:北京朝阳区北辰西路1号院中国科学院遗传发育所
  • 邮编:100101
  • 邮箱:yczz@genetics.ac.cn
  • 电话:010-64807669
  • 国际标准刊号:ISSN:0253-9772
  • 国内统一刊号:ISSN:11-1913/R
  • 邮发代号:2-810
  • 获奖情况:
  • 中国自然科学核心期刊,《CAJ-CD》执行优秀奖,2008年12月获“中国精品科技期刊”证书和北京市印...
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,荷兰文摘与引文数据库,美国生物医学检索系统,美国生物科学数据库,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:23270