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油茶Pht1;2的克隆及生物信息学分析
  • ISSN号:1004-311X
  • 期刊名称:生物技术
  • 时间:2013.2.2
  • 页码:37-42
  • 分类:S714.8[农业科学—林学] S794.4[农业科学—林木遗传育种;农业科学—林学]
  • 作者机构:[1]中南林业科技大学经济林培育与保护教育部重点实验室,湖南长沙410004
  • 相关基金:国家自然科学基金项目(“油茶ACCase基因的分离克隆及功能研究”,No.31070603)资助~~
  • 相关项目:油茶ACCase基因的分离克隆及功能研究
中文摘要:

目的:克隆和分析油茶高亲和磷转运蛋白基因,为研究其结构和功能打下基础。方法:以油茶品种‘华硕’为试材,通过RT—PCR和RACE的方法克隆出油茶磷酸转运子Phtl基因家族一个成员的全长cDNA序列,命名为CoPhtl;2(GenBank登录号:JX412956.1),通过生物信息学技术对其序列的理化性质、结构与功能进行分析和预测。结果:CoPhtl;2CDS长度为1590bp,编码530个氨基酸,与其它物种的Phtl氨基酸序列具有较高的相似性,其中与杨柳科毛果杨的Phtl相似性最高,达到77.5%;该基因所编码蛋白质的分子量为58.02kDa,理论等电点pI为8.97,二级结构主要由a-螺旋、p-折叠和不规则卷曲构成,包含12个明显的跨膜螺旋拓扑结构。结论:预测显示该蛋白是一个疏水跨膜蛋白,具有磷转运蛋白的主要特征,初步判定其与油茶磷吸收有关,其功能有待进一步验证。

英文摘要:

Objective: To provide a basis for structure and function' s research of Phtl in oihea. Method: The phosphate transporter named CoPhtl ;2 was isolated from oil tea( Camellia oleifera ' Huashuo' )with the method of RT -PCR and RACE. Bioinformatics approach was used to analyze and predict the function and domain of CoPhtl ; 2. Result:The CDS of CoPhtl ; 2 is 1 590 bp in length and it codes a pre- dicted protein of 530 amino acids. The amino acid identity compared with other phosphate transporters is highly conserved and showed the highest similarity(77. 5% )with the CoPhtl ;1 of Populus trichocarpa. The estimated molecular weight and isoelectric point of the putative protein were 58.02 kDa and 8. 97. Concluslon:Putative secondary structure and topology of the encoding protein have the main feature of transmembrane protein, and is consistent with Phtl encoding protein in other species.

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期刊信息
  • 《生物技术》
  • 北大核心期刊(2014版)
  • 主管单位:黑龙江省科学院
  • 主办单位:黑龙江省科学院微生物研究所 黑龙江省微生物学会 黑龙江省生物工程学会
  • 主编:张介驰
  • 地址:哈尔滨市道里区兆麟街68号
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  • 国际标准刊号:ISSN:1004-311X
  • 国内统一刊号:ISSN:23-1319/Q
  • 邮发代号:14-225
  • 获奖情况:
  • 中国生物学核心期刊,中国核心期刊(遴选)数据库...
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:13503