位置：成果数据库 > 期刊 > 期刊详情页
为何在蛋白质相互作用网络中伪hub没有致命性?（英文）
  • ISSN号：1000-6737
  • 期刊名称：《生物物理学报》
  • 时间：0
  • 分类：Q51[生物学—生物化学]
  • 作者机构：[1]军事经济学院基础部, [2]国防科学技术大学计算机学院
  • 相关基金：supported by grants from The National Natural Science Foundation of China(60603054,61379056)~~
作者： 董蕴源[1], 王勇献[2]
关键词： 伪hub, 致命性hub, 蛋白质-蛋白质相互作用网络, 致命性
中文摘要：

在系统生物学中,中心性-致命性法则的机制至今仍是一个有争议的问题。但是,在蛋白质-蛋白质相互作用网络中,存在很多伪hub,它们并不具有致命性。为了解释这一现象,作者提出了三个新的度量标准:n-neighbor、n-ip和n-ibep,并从拓扑和功能两方面将伪hub与致命性hub进行比较,发现两者所有的区别都具有统计学意义。实验结果显示伪hub具有更高的进化速率,参与了较少的子图且倾向于与非致命性蛋白质发生相互作用。

同期刊论文项目
高性能并行计算环境下蛋白质相互作用网络的模式解析与功能预测
期刊论文 26 会议论文 2 专利 1
面向数十万核以上异构众核平台的CFD领域性能建模与应用
期刊论文 5
同项目期刊论文
结构网格CFD应用程序在天河超级计算机上的高效并行与优化
有限水深Kelvin源格林函数的传播特性及其应用
大规模CFD多区结构网格任务负载平衡算法
高阶精度CFD应用在天河2系统上的异构并行模拟与性能优化
蛋白质亚细胞定位预测中的序列编码技术
基于模糊支持向量机的膜蛋白分类研究
基于氨基酸和二肽组成的蛋白质四级结构分类研究
基于分组重量编码的蛋白质功能预测
蛋白质的分组重量编码及在结构型预测的应用
多特征融合提取算法结合支持向量机预测膜蛋白类型
蛋白质相互作用网络的几种聚类方法综述
生物医学命名实体识别的研究与进展
A novel method for apoptosis protein subcellular localization prediction combining encoding based on
一种基于KEGG数据库重构代谢网络的新方法
MetaGen: A Promising Tool for Modeling Metabolic Networks from KEGG
代谢网络结构特征的生物信息学研究
利用基于Normal矩阵的谱平分法挖掘酵母蛋白质相互作用网络中的社团
使用多特征联合变量的支持向量机方法预测外膜蛋白
啤酒酵母、秀丽线虫和大肠杆菌蛋白质相互作用网络的近似二分模式分析
k子串离散源结合加权KNN算法预测膜蛋白类型
大规模代谢网络分解的生物信息学研究
一种预测细胞凋亡蛋白的亚细胞定位的新方法
基于相互作用的蛋白质功能预测
基于分组重量编码的蛋白质同源寡聚体分类研究
基于生物信息学方法发现潜在药物靶标
一种基于基因表达模型识别酵母细胞周期条件特异调控子网的方法
MetaGen:从KEGG建模代谢网络的新工具(英文)
基因调控网络的模块化组织研究
期刊信息
  • 《生物物理学报》
  • 北大核心期刊（2011版）
  • 主管单位:中国科协
  • 主办单位:中国生物物理学会
  • 主编：沈恂
  • 地址：北京朝阳区大屯路15号生物物理研究所内
  • 邮编：100101
  • 邮箱：acta@sun5.ibp.ac.cn
  • 电话：010-64888458
  • 国际标准刊号：ISSN：1000-6737
  • 国内统一刊号：ISSN：11-1992/Q
  • 邮发代号:
  • 获奖情况:
  • 二次获得中国科协优秀科技期刊奖
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘（网络版）,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊（2004版）,中国北大核心期刊（2008版）,中国北大核心期刊（2011版）,中国北大核心期刊（2014版）,中国北大核心期刊（2000版）
  • 被引量:7189