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淹水水稻土中氨氧化古菌丰度和群落结构演替特征
  • ISSN号:1672-2043
  • 期刊名称:农业环境科学学报
  • 时间:2014
  • 页码:999-1006
  • 分类:X172[环境科学与工程—环境科学]
  • 作者机构:[1]西北农林科技大学生命科学学院,陕西杨凌712100, [2]西北农林科技大学资源环境学院,陕西杨凌712100
  • 相关基金:国家大学生创新创业训练计划项目(1210712163);国家自然科学基金项目(41171204)
  • 相关项目:厌氧水稻土中梭菌和芽孢杆菌的群落结构特征及其对异化铁还原的贡献
中文摘要:

采用淹水非种植水稻土微环境模式系统,对水稻土进行1 h和1、5、10、20、30、40、60 d淹水培养,利用序列分析和Realtime PCR技术分析淹水培养过程中氨氧化古菌(AOA)的丰度和群落结构变化规律。结果表明,淹水水稻土中细菌(Bac)的丰度是泉古菌(Cre)的29倍以上,而氨氧化古菌(AOA)是氨氧化细菌(AOB)的4倍之多,淹水过程改变了细菌、泉古菌、氨氧化细菌和氨氧化古菌的丰度。基于Arch-amoA基因的OTU分析显示淹水过程中AOA的群落结构发生了演替性变化:T12是r策略生存的AOA,仅存在于淹水初期;T4、T5和T9是k策略生存的AOA,存在于淹水后期;T1、T8和T16是r和k-策略共生存的AOA,它们存在于整个淹水过程中,淹水后期k-策略的AOA占据优势。淹水初期优势种群多样性指数大于淹水中、后期,PCA分析将淹水处理过程分成初期、中期和后期3类不同的生境;测序结果表明,16个优势OTU类型均属于泉古菌,且与来自不同地域的水稻土、旱地土、红壤和沉积物氨氧化古菌关系密切。

英文摘要:

Ammonia-oxidizing archaea( AOA ) play an important role in ammonium oxidation in soil ecosystem, and predominate among ammonia-oxidizing prokaryotes in paddy soils. In this study, dynamic changes of abundance and community structures of ammonia-oxidizing arehaea were investigated in paddy soils that were flooded for 1 h, 1 d, 5 d, 10 d, 20 d, 30 d, 40 d and 60 d, using sequential analysis and real-time PCR. The abundance of bacteria was 29 times that of crenarchaeota, while AOA was 4 times ammonia-oxidizing bacteria(AOB). Based-on arch-arnoA gene, OTU analysis showed that the AOA community structures shifted at different flooding times :T12, a type of AOA and r-strategist organism, was present only at the early flooding time. T4, T5 and T9, k-strategist organisms, existed at the late flooding time. T1, T8 and T16, r-k-strategist symbiotic organisms, appeared during whole flooding period. AOA predominated at the late flooding time. The diversity index of dominant groups was larger at the early flooding than at the middle and late flooding times. Sequencing results showed that all 16 dominant OTU types belonged to erenarchaeota, and had a close relationship with AOA from paddy soil, dry highland soil, red soil and sediments in different regions.

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期刊信息
  • 《农业环境科学学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中华人民共和国农业部
  • 主办单位:农业部环境保护科研监测所 中国农业生态环境保护协会
  • 主编:李文华
  • 地址:天津市南开区复康路31号
  • 邮编:300191
  • 邮箱:caep@vip.163.com
  • 电话:022-23674336 23006209
  • 国际标准刊号:ISSN:1672-2043
  • 国内统一刊号:ISSN:12-1347/S
  • 邮发代号:6-64
  • 获奖情况:
  • 全国中文核心期刊,列于被引频比最高的中国科技期刊500名之内
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,美国剑桥科学文摘,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:34877