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基于演化学习超网络的微阵列数据分类
  • ISSN号:1671-7775
  • 期刊名称:江苏大学学报(自然科学版)
  • 时间:2014
  • 页码:56-62
  • 分类:TP391.4[自动化与计算机技术—计算机应用技术;自动化与计算机技术—计算机科学与技术]
  • 作者机构:[1]重庆邮电大学计算智能重庆市重点实验室,重庆400065
  • 相关基金:国家自然科学基金资助项目(61203308,61075019);重庆市自然科学基金资助项目(cstc2012jjA40034);重庆市大学生创新创业训练计划项目(201210617003).
  • 相关项目:面向不平衡数据分类的演化硬件集成学习方法研究
中文摘要:

为解决传统模式识别方法学习结果过于复杂且难以解读的问题,提出了一种基于遗传算法的演化学习超网络模型.与传统的基于梯度下降和超边替代的超网络学习算法不同,演化学习超网络模型在其学习过程中引入了遗传算法.将超网络的超边集合划分成多个子种群;对子种群中的个体进行选择、交叉和变异等遗传操作,并对每一代种群进行子种群间优秀个体的迁移.每个子种群并行执行演化操作,完成演化后得到一个具有决策能力的超网络分类器.利用演化超网络对急性白血病、肺癌和前列腺数据集进行分类试验.结果表明,演化学习超网络对3个数据集的分类准确率分别为96.21%,99.26%,96.09%.所提出的方法与其他传统的模式识别方法相比,具有更高的分类准确率,而且其学习结果具有很好的可读性,有利于挖掘与癌症诊断密切相关的基因对高阶关联关系.

英文摘要:

In order to solve the shortcoming of relatively complicate and barely intelligible classification result of most conventional machine learningbased pattern recognition method, an evolutionary learning hypernetwork evolved by a genetic algorithm was proposed. Differed from the traditional hypernetwork based on a gradient descent or a hyperedge replacement scheme as system learning machine, a genetic al gorithm was employed in the learning process of the proposed evolutionary learning hypernetwork. In the system learning process, the hyperedges of hypernetwork were divided into several subgroups for the in dividuals to be evolved independently with selection, crossover and mutation operations. The outstanding individuals were migrated to the neighbor subgroup in every generation. Every subgroup was evolved with genetic algorithm parallel, and eventually contributed to a hypernetworkbased classifier with the ability of decisionmaking. The evolved hypernetwork was used to classify the data set of acute leukemia, lung cancer and prostate. The experimental results show that the proposed approach leads to a very com parable classification performance with data set accuracies of 96.21% on acute leukemia, 99.26% on lung cancer and 96.09% on prostate, respectively. The learning results of the proposed hypernetwork aremore readable than those of other traditional classification methods. The proposed scheme can efficiently discover significant high order interactions of gene pairs for cancer classification.

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期刊信息
  • 《江苏大学学报:自然科学版》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:江苏省教育厅
  • 主办单位:江苏大学
  • 主编:袁寿其
  • 地址:江苏省镇江梦溪园巷30号
  • 邮编:212003
  • 邮箱:xbbj@ujs.edu.cn
  • 电话:0511-84446612
  • 国际标准刊号:ISSN:1671-7775
  • 国内统一刊号:ISSN:32-1668/N
  • 邮发代号:28-83
  • 获奖情况:
  • 原“机械电子部优秀科技期刊二等奖,江苏省高校学报优秀期刊一等奖,江苏省优秀科技期刊奖,江苏省期刊方阵优秀期刊,华东地区优秀期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),美国数学评论(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,波兰哥白尼索引,德国数学文摘,荷兰文摘与引文数据库,美国剑桥科学文摘,英国科学文摘数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:8727