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振动探针用于丙氨酸二肽在氯仿溶剂中的结构研究
  • ISSN号:1000-5277
  • 期刊名称:福建师范大学学报(自然科学版)
  • 时间:2014
  • 页码:87-92
  • 分类:O641[理学—物理化学;理学—化学]
  • 作者机构:[1]福建师范大学化学与化工学院,福建福州350117
  • 相关基金:国家自然科学基金资助项目(21103021);福建省自然科学基金资助项目(2011J05022);福建省教育厅资助项目(JBl2005);福建省高校杰出青年科研人才培育计划项目(JAl3063);福建师范大学优秀青年骨干教师培养基金资助项目(fisdjk2012066)
  • 相关项目:蛋白质多肽分子体系动态结构及超快振动光谱参数研究
中文摘要:

利用从头算方法探索蛋白质模型分子——丙氨酸二肽在氯仿溶剂环境下的二级结构布居特征.借助对分子结构敏感的振动探针(酰胺振动吸收带)的光谱表象,寻求振动光谱参数与分子结构之间的联系.研究结果表明,丙氨酸二肽分子倾向于形成 β折叠、PPⅡ、C7eq和c,等构型.简正模式分析结果表明分子内酰胺振动带对分子骨架变化十分敏感,因此可以将酰胺振动吸收带作为结构探针研究蛋白质分子的二级结构信息.

英文摘要:

The population of the secondary structures of alanine dipeptide in chloroform was in- vestigated by means of ab initio calculation. The vibrational parameters of amide modes, which were known to be quite sensitive to the secondary structure of peptide, were calculated to reveal the correlation between the vibrational spectrum and the molecular structure. It was found that alanine dipeptide trends to form the conformations like β , PPⅡ, C7eq and C5. Normal mode analysis showed that the vibrational parameters of amide motions were very sensitive to the backbone confor- mation of alanine dipeptide, therefore, the amide vibrational modes can be used as structural probe in the determination for the secondary structure of the orotein and oolvoeotide.

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期刊信息
  • 《福建师范大学学报:自然科学版》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:福建师范大学
  • 主办单位:福建师范大学
  • 主编:余望
  • 地址:福州市福建师范大学旗山校区
  • 邮编:350117
  • 邮箱:linmin@fjnu.edu.cn
  • 电话:0591-22867857
  • 国际标准刊号:ISSN:1000-5277
  • 国内统一刊号:ISSN:35-1074/N
  • 邮发代号:34-43
  • 获奖情况:
  • 福建省优秀科技期刊,全国优秀高校自然科学学报,华东地区优秀期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),德国数学文摘,美国剑桥科学文摘,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:7294