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肉眼看微观世界:VMD软件在蛋白质结构教学中的应用
  • ISSN号:1003-3807
  • 期刊名称:《化学教育》
  • 时间:0
  • 分类:O6-33[理学—化学]
  • 作者机构:[1]福建师范大学化学与化工学院,福建福州350007, [2]福建省理论与计算化学重点实验室,福建厦门361005
  • 相关基金:国家自然科学基金(21103021);福建省高校杰出青年科学人才培育计划(JA13063);福建师范大学大学生创新创业项目(201510394056)
中文摘要:

主要探讨了VMD软件作为一个高效的可视化工具在蛋白质三维结构教学中的应用。它帮助学生用一种更加直观、立体且富于互动的方式认识蛋白质分子不同的折叠方式及其二级结构特性。借助VMD软件还能对处于不停热运动中的分子瞬态结构进行统计分析,有助于学生深化对蛋白质倾向于形成的二级结构的认识。

英文摘要:

This paper discussed the application of VMD software in the teaching of three di- mensional structure of protein. VMD can help students to understand folding patterns and the secondary structure feature of protein in an interactive, more direct and visual way. VMD also can summarize the structure data from instantaneous structures of molecules in thermal dynamic situation, and the statistic results are helpful for a better understanding about the tendency of forming specific secondary structure of protein.

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期刊信息
  • 《化学教育》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中国科学技术协会
  • 主办单位:中国化学会 北京师范大学
  • 主编:刘正平
  • 地址:北京市新街口外大街19号,北京师范大学化学楼217室
  • 邮编:100875
  • 邮箱:hxjy-jce@263.net
  • 电话:010-58807875
  • 国际标准刊号:ISSN:1003-3807
  • 国内统一刊号:ISSN:11-1923/O6
  • 邮发代号:2-106
  • 获奖情况:
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:12069