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抗菌肽HP(2-20)与POPE脂膜相互作用的分子动力学模拟
  • ISSN号:1000-565X
  • 期刊名称:华南理工大学学报(自然科学版)
  • 时间:2012.10.10
  • 页码:211-218
  • 分类:Q66[生物学—生物物理学]
  • 作者机构:[1]华南理工大学生物科学与工程学院,广东广州510006
  • 相关基金:国家自然科学基金资助项目(10772069,10972081,11072080,31170887); 广东省工业攻关项目(2008B011000017)
  • 相关项目:金属蛋白酶ADMATS-13水解酶切血管性血友病因子vWF的力学调控机制
中文摘要:

作为传统抗生素有力的候选者,抗菌肽是先天免疫体系中的重要组成成分.抗菌肽从起初的接触至随后稳定地吸附到细菌CC的质膜之上,是抗菌肽发挥其抗菌功能的关键初始事件.为揭示这一尚未明了的过程,文中使用分子动力学模拟方法,通过构建抗菌肽HP(2-20)与POPE脂双层的体系,模拟了HP(2-20)与POPE脂膜间的非特异相互作用.结果表明:抗菌肽的N端最先与脂膜接触,随后抗菌肽将维持一种倾斜的姿态,经历一个旋动插入脂膜的过程;同时,抗菌肽将束缚膜上与其邻近的磷脂分子的运动,导致膜的不均匀性,增强脂膜磷脂分子的无序波动,为其它自由的抗菌肽分子更深的插入提供了机会.

英文摘要:

As one of the most likely substitutes for conventional antibiotics, antimicrobial peptides (AMPs) are ancient players in innate immunity. In the antimicrobial action of AMPs, an initial key event is that AMPs firstly contact with and then closely adhere to the bacterial membrane. In order to reveal this unknown process, a molecu- lar dynamic (MD) simulation is performed to examine the nonspecific interaction of AMP HP(2-20) with the cell membrane, which is modeled by a POPE bilayer. The results show that the N-terminal of the peptide firstly contacts with the membrane, and then, companying with a rotation movement, the peptide slowly inclines toward and slightly inserts into the membrane; at the same time, the AMP limits the movements of the lipids adjacent to the peptide, which induces the membrane to become non-uniform and enhances the irregular fluctuation of the lipids, so that other peptides may find their chances of deeply inserting into the membrane.

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期刊信息
  • 《华南理工大学学报:自然科学版》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:国家教育部科技司
  • 主办单位:华南理工大学
  • 主编:李元元
  • 地址:广州市天河区五山路华南理工大学17号楼
  • 邮编:510640
  • 邮箱:journal@scut.edu.cn
  • 电话:
  • 国际标准刊号:ISSN:1000-565X
  • 国内统一刊号:ISSN:44-1251/T
  • 邮发代号:46-174
  • 获奖情况:
  • 本学报荣获1996年国家教委系统优秀科技期刊二等奖...,1999年荣获全国优秀高校自然科学学报及教育部优秀...,2001年荣获广东省优秀期刊奖和广东省优秀科技期刊...,2004年获全国高校优秀科技期刊二等奖,2006年获首届教育部优秀科技期刊奖,2008年荣获第二届教育部优秀科技期刊奖
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),荷兰文摘与引文数据库,美国工程索引,美国剑桥科学文摘,英国科学文摘数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:22954