作为先天免疫体系的重要成分,抗菌肽不仅对细菌、真菌和病毒等有直接杀伤作用,还对免疫体系具有重要的调控作用。关于抗菌肽的结构功能关系是当前的一个热点科学问题。本项目主要研究抗菌肽的柔性对抗菌肽活性的影响,取得了如下研究成果1、建立了基于拉伸分子动力学(SMD)模拟的小分子拉伸刚度的提取方法,并获得了抗菌肽HP(2-20)及其四个类似物的刚度信息;2、发现了抗菌肽基于刚度的构效关系,即随着刚度的增大,抗菌肽的抑菌活性也随之增强;3、基于B-factor的柔性评估方法,首次定量预报了(9组)抗菌肽柔性;4,我们发现柔性是调控抗菌肽抑菌活性的一个关键要素,相应调控过程呈现双相特征当柔性处于较低水平时,柔性的增加将上调抗菌肽抑菌活性水平,提示抗菌肽功能的发挥需要一定的柔性水平;但是随着分子柔性已增加到较高水平时,柔性的增加不仅不会上调抗菌肽抑菌活性水平,而且会降低抗菌肽到抑菌活性。我们推测,上述柔性依赖抗菌肽抑菌行为或活性水平,和二个相互关联的力学调控机制相关,也就是,过大的结构柔性,大大降低了抗菌肽结构的稳定性,使得不利于抑菌功能的发挥.
英文主题词antimicrobial peptide; flexibility; structure-activity relationship; mechanical mechanism