位置:成果数据库 > 期刊 > 期刊详情页
细粒棘球蚴重组抗原P-29结构与功能的生物信息学分析
  • ISSN号:1001-8883
  • 期刊名称:国外医学(医学地理分册)
  • 时间:2011
  • 页码:87-90
  • 期号:02
  • 便笺:61-1102/R
  • 分类:R378[医药卫生—病原生物学;医药卫生—基础医学]
  • 作者地址:宁夏医科大学检验学院;宁夏医科大学附属医院医学实验中心;宁夏医科大学科技中心;
  • 作者机构:[1]宁夏医科大学检验学院, [2]宁夏医科大学附属医院医学实验中心, [3]宁夏医科大学科技中心,宁夏银川750004
  • 相关基金:基金项目:国家自然科学基金资助(No.30260105;30660176),宁夏自然科学基金资助(No.NZ0540).
中文摘要:

目的应用生物信息学分析软件预测细粒棘球蚴重组抗原P-29氨基酸序列的结构与功能。方珐应用NCBI、Expasy等在线生物信息学网站及DNAstar、Rasmol等软件包分析P-29与其他物种的同源序列,进行多序列同源比对;预测二级结构、三级结构;预测主要抗原表位等。结果细粒棘球绦虫重组抗原P-29与其他物种的同源性比对结果表明与多房棘球绦虫同源性最高为97%,依次为日本血吸虫73.9%,冈比亚按蚊70.5%,埃及伊蚊66.2%;预测该蛋白分子质量约为27ku,PI为5.69,具有1个跨膜区,位于212—215,8个抗原表位,其结构域位于5-238位。结论生物信息学预测结果提示该可能是免疫诊断、药物作用及疫苗潜在的靶分子。

英文摘要:

Objective To predict the structure and function of recombinant antigen P-29 of Echinococcus granulous (rEg. P-29) using bioinformatics method. Methods By online analysis at bioinformatics websites such as NCB[(http://www. nibi. nlm. nih. gov/)and Expasy (http..//cn. expasy, org/), and employing software packages such as DNAstar and Rasmolto do multi-sequence homological alignment, secondary structure and tertiary structure, antigenic epitope analysis, etc. Results Similarity of rEg. P-29 compared to Echinococcus multilocularis, Schistosoma japonicum, Anopheles Gambia and Aedes aegypti was 97%, 73.96%, 70.5%, 66.2% respectively. Analysis of the predicted protein indicated a molecular mass of 27 ku, PI was 5.69, one transmembrane region, function sites and eight antigen epitope were found. Conclusion rEg. P-29 might be a potential molecular target for immunodiagnosis, anti-hydatid drug and vaccine development.

同期刊论文项目
同项目期刊论文
期刊信息
  • 《国外医学:医学地理分册》
  • 主管单位:中华人民共和国教育部
  • 主办单位:西安交通大学
  • 主编:郭雄
  • 地址:西安市雁塔西路76号
  • 邮编:710061
  • 邮箱:medgeography@mail.xjtu.edu.cn
  • 电话:029-82655064
  • 国际标准刊号:ISSN:1001-8883
  • 国内统一刊号:ISSN:61-1102/R
  • 邮发代号:52-26
  • 获奖情况:
  • 2007年10月被评为全国期刊出版形式规范A类期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版)
  • 被引量:3153