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快速提取肠道微生物基因组DNA的方法
  • ISSN号:1673-6273
  • 期刊名称:《现代生物医学进展》
  • 时间:0
  • 分类:Q-33[生物学] Q93-3[生物学—微生物学]
  • 作者机构:[1]上海交通大学药学院,上海200240
  • 相关基金:国家自然科学基金重大研究计划资助项目(No.90209059;No.90409018)
中文摘要:

目的:肠道微生物的研究日益成为热点,如何获取高质量、较完整的肠道菌群基因组DNA是肠道微生物研究中的关键。本文通过对酚/氯仿法提取总DNA过程进行考察和优化,建立一种简便酚/氯仿抽提法。方法:考察和优化酚/氯仿法提取总DNA的过程,并根据DNA产量、纯度以及ERIC-PCR及16SrNDA-RFLP所反映的微生物群落结构特性的指标,并与QIAamp?DNAStool Mini Kit提取的进行比较,评价了所建立的快速提取方法。结果:用简便酚/氯仿法得到基本完整的基因组DNA,ERIC-PCR和16S r DNA-RFLP结果与QIAamp?DNA Stool Mini Kit法基本相同。结论:该方法快速并成本低,适合肠道微生物研究中总DNA提取,尤其适合处理大批量的样品。

英文摘要:

Objective: The aim of this study is to establish a simple and convenient method of extracting genomic DNA from intestinal microorganism through the examination and optimization of the whole extracting process. Methods: The whole extracting DNA process, by hydroxybenzene/chloroform, was examined and optimized, which was compared with those extracted by OIAamp DNA Stool Mini Kit, according to the output and purity of DNA and the indexes of structure and property of mi- croorganism community reflected by ERIC-PCR and 16S rDNA-RFLP.And then the quickly extracting DNA method established was evaluated. Results: The results of the two methods of extracting DNA were basically identical. Conclusion: This method established is cheap, quick and easy to do, which is suitable for extracting total DNA from intestinal microorganism,especially for dealing with quantities of samples,

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期刊信息
  • 《现代生物医学进展》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:黑龙江省卫生厅
  • 主办单位:黑龙江省红十字医院 黑黑龙江省红十字医院 黑龙江省森林工总医院
  • 主编:申宝忠
  • 地址:哈尔滨市南岗区花园街184号403
  • 邮编:150001
  • 邮箱:biomed_54@126.com
  • 电话:0451-82583800 53658268
  • 国际标准刊号:ISSN:1673-6273
  • 国内统一刊号:ISSN:23-1544/R
  • 邮发代号:14-12
  • 获奖情况:
  • 国内外数据库收录:
  • 被引量:33230