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基于设计模板的BRD-like折叠类型综合分类方法
  • ISSN号:0251-0790
  • 期刊名称:《高等学校化学学报》
  • 时间:0
  • 分类:Q518[生物学—生物化学]
  • 作者机构:北京工业大学生命科学与生物工程学院,北京100124
  • 相关基金:国家自然科学基金资助项目(N0.21173014)和北京市自然科学基金资助项目(No.4112010).
中文摘要:

蛋白质折叠规律研究是生命科学重大前沿课题,折叠类型分类是蛋白质折叠研究的基础。构建BRD—like折叠类型模板数据库,建立了基于多模板的综合分类方法,并用于该折叠类型的分类。对实验集的12117个样本进行检验,结果的敏感性、特异性分别为0.923和0.997,MCC值为0.72;对独立检验集2260个样本的检验,结果发现:敏感性、特异性分别为0.941和0.998,MCC值为0.86.结果表明:基于多模板的综合分类方法可用于蛋白质折叠类型分类。

英文摘要:

The study on principle of protein folding is a cutting-edge topic in life science, and folding type classification is the basis of protein folding research. In this paper, we constructed a template database of BRD-like folding type, and established a comprehensive classification method based on multiple templates. Our method is used for the classification of BRD-like folding. We tested the training set of 12 117 samples,and found that the sensitivity,specificity and MCC were 0.923,0.997 and 0.72 respectively.Then we tested the 2 260 samples of the independent test, and found that the sensitivity, specificity and MCC were 0.941,0.998 and 0.86 respectively. These results indicated that the comprehensive classification method based on multiple templates could be used for the classification of protein folding.

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期刊信息
  • 《高等学校化学学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中华人民共和国教育部
  • 主办单位:吉林大学 南开大学
  • 主编:周其凤
  • 地址:吉林大学南胡校区
  • 邮编:130012
  • 邮箱:cjcu@jlu.edu.cn
  • 电话:0431-88499216
  • 国际标准刊号:ISSN:0251-0790
  • 国内统一刊号:ISSN:22-1131/O6
  • 邮发代号:12-40
  • 获奖情况:
  • 首届及第二届国家期刊奖,连续两届“百种中国杰出学术期刊”,中国期刊方阵“双高”期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),荷兰文摘与引文数据库,美国工程索引,美国科学引文索引(扩展库),日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),英国英国皇家化学学会文摘,中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:50676