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海绵中提取的异臭椿萜类化合物作用靶标的识别
  • ISSN号:1000-6818
  • 期刊名称:《物理化学学报》
  • 时间:0
  • 分类:O641[理学—物理化学;理学—化学]
  • 作者机构:[1]北京大学药学院,天然药物及仿生药物国家重点实验室,北京100191
  • 相关基金:重大新药创制国家科技重大专项(2009ZX09501-002); 国家自然科学基金(20802006)资助项目.
中文摘要:

采取了包括化学结构相似性学习、靶标聚类分析以及反向对接筛选等多种方法在内的综合性策略,尝试对中国南海海绵中提取得到的异臭椿萜类化合物进行生物学活性和作用靶标的预测.结果表明:这类化合物具有治疗心肌缺血和抗肿瘤的潜在生物学活性;表皮细胞生长因子受体(EGFR),焦点(局部)粘着斑激酶(FAK),胰岛素样生长因子1受体(IGF1-R),c-Src激酶以及血管表皮生长因子受体2(VEGF-R2)是这类化合物可能的作用靶标.IC50值从0.41g·m-3(0.41μg·mL-1)到9.8g·m-3(9.8μg·mL-1)不等.活性数据显示这些海绵提取的海洋天然产物可作为先导化合物,通过进一步的优化获得新的药物.同时还讨论了化合物与预测靶标的结合模式,结果显示四个化合物都与相应的受体有较好的结合.

英文摘要:

A strategy combining structure alignment and comparation, target cluster, and invert-docking screening were undertaken to detect the potential bioactivities of several isomalabaricane triterpenoids that were extracted from sponge. The prediction results revealed that the chemicals underwent myocardial ischemia treatment and had antineoplastic bioactivities. Enzymatic bioassays showed that epidermal growth factor receptor (EGFR), focal adhesion kinase (FAK), insulin-like growth factor 1 receptor (IGF1-R), c-Src kinase, and vascular endothelial growth factor receptor 2 (VEGF-R2) were potential targets for these compounds. They had IC50 values ranging from 0.41 g·m-3 (0.41 μg·mL-1) to 9.8 g·m-3 (9.8 μg·mL-1), which is meaningful for the use of these marine natural products as leads for further modifications to new agents. Ligand-target binding mode with these compounds were undertaken and indicated that the four studied chemicals bound well with the targets.

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期刊信息
  • 《物理化学学报》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中国科学技术协会
  • 主办单位:北京大学化学与分子工程学院承办
  • 主编:刘忠范
  • 地址:北京大学化学楼
  • 邮编:100871
  • 邮箱:whxb@pku.edu.cn
  • 电话:010-62751724
  • 国际标准刊号:ISSN:1000-6818
  • 国内统一刊号:ISSN:11-1892/O6
  • 邮发代号:82-163
  • 获奖情况:
  • 中文核心期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),荷兰文摘与引文数据库,美国科学引文索引(扩展库),英国科学文摘数据库,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),英国英国皇家化学学会文摘,中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:24781