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植物代谢组学数据分析和数据库
  • ISSN号:1004-0374
  • 期刊名称:生命科学
  • 时间:2015
  • 页码:995-999
  • 分类:Q94-3[生物学—植物学] R969.1[医药卫生—药理学;医药卫生—药学]
  • 作者机构:[1]中国科学院植物研究所植物分子生理学重点实验室,北京100093
  • 相关基金:基金项目:国家重点基础研究发展计划(“973”项目)(2013CB127005);国家高技术研究发展计划(“863”计划)(2012AA10A304-3);国家自然科学基金项目(31200227)
  • 相关项目:水稻杂种优势的代谢模式研究
中文摘要:

植物代谢组学是近年发展起来的进行植物生物学研究的新兴学科,目前的难点和热点是数据分析和信息挖掘。现针对植物代谢组学数据分析和信息挖掘过程中涉及的几个主要方面进行了概述,内容包括数据特点、分析流程、软件和数据库。系统地介绍了植物代谢组数据分析预处理、常用统计分析原理和适用条件、数据分析中的注意事项、常用软件和数据库的优缺点,最后探讨了植物代谢组数据分析的问题和新发展动态。

英文摘要:

Plant metabolomics is a newly emerging 'omics', which has been widely used in plant science research. Data analysis and data mining are the hotspots and the most difficult aspects of plant metabolomics research. In this review, we summarized the major aspects of data analysis and data mining, including the characteristics of metabolomics data, procedure of data analysis, major software packages and public databases. Also data pre- processing, the statistic principle and methods used in metabolomics data analysis, and the characteristics of major software and public databases were introduced in detail. Finally, we discussed the current situation and prospect of plant metabolomics data analysis.

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期刊信息
  • 《生命科学》
  • 北大核心期刊(2008版)
  • 主管单位:中国科学院
  • 主办单位:国家自然科学基金委员会生命科学部 中国科学院生命科学与生物技术局 中国科学院生命科学和医学学部 中国科学院上海生命科学研究院
  • 主编:王恩多
  • 地址:上海岳阳路319号31号楼B座403中国科学院上海文献情报中心
  • 邮编:200031
  • 邮箱:CBLS@SIBS.AC.CN
  • 电话:021-54922830
  • 国际标准刊号:ISSN:1004-0374
  • 国内统一刊号:ISSN:31-1600/Q
  • 邮发代号:4-628
  • 获奖情况:
  • 1996年获上海市优秀科技期刊评比一等奖
  • 国内外数据库收录:
  • 中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2008版)
  • 被引量:9112