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齿裂菌属和皮下盘菌属ISSR—PCR最佳反应条件的研究
  • ISSN号:1672-3538
  • 期刊名称:《菌物研究》
  • 时间:0
  • 分类:Q75[生物学—分子生物学] Q949.325[生物学—植物学]
  • 作者机构:[1]安徽农业大学林学与园林学院,合肥230036, [2]安徽农业大学生命科学学院,合肥230036
  • 相关基金:国家自然科学基金项目(30370011,30470014),安徽省自然科学基金项目(070411005)
中文摘要:

在利用ISSR技术分析齿裂菌属和皮下盘菌属遗传多样性的研究中,为获得条带清晰、重复性好的ISSR扩增结果,对影响ISSR—PCR的条件进行了筛选,确定了此类菌物ISSR—PCR反应的最适宜条件:在15μL PCR反应体系中,10倍Taq酶缓冲液1.5μL,DNA模板8ng/μL,MgCl2 2.5mmol/L,dNTP0.15mmol/L,引物浓度0.4μmol/L,Taq酶1.00U,ddH2O 9.0μL。最佳退火温度因不同的引物而定,最佳循环次数为35次。

英文摘要:

The factors which affect the ISSR analysis in the study of the genetic diversity of Coccomyces De Not. and Hypoderma De Not., such as concentrations of template DNA, Taq DNA polymerase, Mg^2 +, primer and dNTP, annealing temperature, cycling times, etc. were filtrated. The optimal ISSR - PCR conditions in the experiments were as the following: 10 × Taq buffer 1.5μL, template DNA 8 ng/μL, MgCl2 2.5 mmol/L, dNTP 0.15 mmol/L, primer concentration 0.4 mmol/L, Taq DNA pelymerase 1.00 U, and ddH20 9.0 μL in total 15 μL reaction volumes. Optimal annealing temperature is decided by different primers. Optimal circular time is thirty-five. The amplification system can give clear and reproducible banding patterns.

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期刊信息
  • 《菌物研究》
  • 主管单位:吉林省教育厅
  • 主办单位:吉林农业大学 中国菌物学会
  • 主编:李玉
  • 地址:吉林省长春市新城大街2888号吉林农业大学
  • 邮编:130118
  • 邮箱:jwyjiu@126.com
  • 电话:0431-84533357
  • 国际标准刊号:ISSN:1672-3538
  • 国内统一刊号:ISSN:22-1352/S
  • 邮发代号:
  • 获奖情况:
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,美国生物科学数据库
  • 被引量:2255