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滇龙胆香叶醇-10-羟化酶基因克隆、生物信息学分析和表达
  • ISSN号:0253-2670
  • 期刊名称:《中草药》
  • 时间:0
  • 分类:R282.12[医药卫生—中药学;医药卫生—中医学]
  • 作者机构:云南中医学院中药学院,云南昆明650500
  • 相关基金:国家自然科学基金资助项目(81660634); 云南省科技计划项目(2014FZ077); 云南省教育厅重点项目(2013Z002); 云南省应用基础研究-中医联合专项[2015FB205(-024)]
中文摘要:

目的克隆滇龙胆Gentiana rigescens香叶醇-10-羟化酶(geraniol-10-hydroxylase,G10H)基因,对其进行定量表达以及生物信息学分析。方法采用PCR技术获得G10H的c DNA序列,对G10H蛋白进行理化性质、二级结构和三级结构等生物信息学分析,并利用实时荧光定量PCR方法检测G10H基因在滇龙胆根、茎、叶中的表达情况。结果克隆得到滇龙胆G10H基因,全长为1 400 bp,ORF 1 248 bp,编码415个氨基酸。生物信息学预测该基因编码蛋白质分子式为C2131H3390N586O615S17,等电点为7.62,不稳定系数为44.20,疏水性系数GRAVY为-0.245。G10H基因在滇龙胆根、茎、叶中均有表达,其中在根中表达量最高,茎中最低。结论首次从滇龙胆中克隆得到了G10H基因,为进一步阐明该基因的羟基化功能在滇龙胆龙胆苦苷生物合成途径中的重要作用奠定基础。

英文摘要:

Objective To clone the geraniol-10-hydroxylase(G10H) gene from Gentiana rigescens and analyze the gene expression. Methods The c DNA sequence of G10 H was obtained from G. rigescens using PCR technique. The physical and chemical properties, secondary structure and tertiary structure of G10 H protein were forecasted and analyzed using related software. The expression of G10 H gene was detected using real-time PCR in roots, stems, and leaves of G. rigescens. Results The cloned G10 H gene was 1 400 bp including 1 248 bp open reading frame and encoding a predicted protein of 415 amino acids. Bioinformatics predicted that the gene encoding protein molecular formula was C2131H3390N586O615S17, the isoelectric point was 7.62, the instability coefficient was 44.20, and the hydrophobic coefficient was-0.245. RT-PCR showed that G10 H gene expressed in all organs. And the highest expression level was found in roots, while the lowest in the stems. Conclusion This G10 H gene is cloned from G. rigescens for the first time. The results provide a foundation for exploring the mechanism of gentiopicroside biosynthesis in G. rigescens.

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期刊信息
  • 《中草药》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:天津市科委
  • 主办单位:中国药学会 天津药物研究院
  • 主编:汤立达
  • 地址:天津市南开区鞍山西道308号
  • 邮编:300193
  • 邮箱:zcy@tiprpress.com
  • 电话:022-27474913 23006821
  • 国际标准刊号:ISSN:0253-2670
  • 国内统一刊号:ISSN:12-1108/R
  • 邮发代号:6-77
  • 获奖情况:
  • 国家期刊奖,国家“双奖”期刊,1992年获国家科委、中共中央宣传部、国家新闻出版...
  • 国内外数据库收录:
  • 美国国际药学文摘,美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,波兰哥白尼索引,荷兰文摘与引文数据库,荷兰医学文摘,美国剑桥科学文摘,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),英国英国皇家化学学会文摘,中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:90909