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反相高效液相色谱法测定人乳腺癌MCF7细胞中基因组DNA甲基化水平
  • ISSN号:0258-4646
  • 期刊名称:《中国医科大学学报》
  • 时间:0
  • 分类:O657.72[理学—分析化学;理学—化学] Q523[生物学—生物化学]
  • 作者机构:[1]中国医科大学附属第一医院中心实验室,沈阳110001
  • 相关基金:国家自然科学基金资助项目(30571701)
中文摘要:

目的利用反相高效液相色谱法检测MCF7细胞系中基因组DNA的甲基化水平。方法采用Nano LC(75μm×15 cm,5μm)和Micro LC(1.0 mm×15 cm,5μm)的C18反相色谱柱,以甲醇-醋酸铵缓冲液(pH 5.0)为流动相,使用线性梯度程序,将MCF7细胞中基因组DNA水解产物进行分离,两种体系流速分别是300 nl/min和40μl/min,在273 nm波长处检测,利用外标法分别检测DNA中脱氧胞嘧啶(dC)和甲基化脱氧胞嘧啶(5mdC)含量。结果 MCF7基因组DNA的水解产物,经反相色谱分离得到的峰图有较好的准确性与重复性;DNA水解后的产物为弱保留化合物,且Micro LC分离效果优于Nano LC;乳腺癌细胞MCF7甲基化水平为19.3%,高于正常细胞中基因组DNA甲基化水平。结论成功的将MCF7细胞中基因组DNA水解产物经反相色谱分离;使用Micro LC分离DNA水解后的弱保留产物较佳;MCF7细胞系基因组DNA甲基化水平高于正常细胞。

英文摘要:

Objective To detect the genomic DNA methylation in human breast cancer cell line MCF7 with reversed-phase high performance liquid chromatography(HPLC).Methods The products of genomic DNA hydrolysis in MCF7 cells were chromatographed on Nano LC(75 μm×15 cm,5 μm)and Micro LC(1.0 mm×15 cm,5 μm)with ultraviolet detection at 270 nm,and eluted by the mobile phase of MeOH-NH4Ac(pH 5.0)at the flow rates of 300 nl/min and 40 μl/min under the condition of linear gradient program.The amounts of 2′-deoxycytidine(dC)and 5-methyl-2′-deoxycytidine(5mdC)were determined by external standard method.Results The products of DNA hydrolysis were successfully separated by reversed-phase HPLC with good repeatability and accuracy.The products were weakly retained and separated better by Micro LC.The level of global DNA methylation in MCF7 cells was 19.3%,which was higher than that in normal cells.Conclusion The products of DNA hydrolysis in MCF7 cells could be successfully separated by reversed-phase HPLC.Micro LC is superior to Nano LC in separating weak retention compounds of hydrolysis products.The level of DNA methylation is higher in MCF7 cells than in normal cells.

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期刊信息
  • 《中国医科大学学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:辽宁省教育厅
  • 主办单位:中国医科大学
  • 主编:闻德亮
  • 地址:沈阳市沈北新区蒲河路77号
  • 邮编:110122
  • 邮箱:
  • 电话:024-31939622
  • 国际标准刊号:ISSN:0258-4646
  • 国内统一刊号:ISSN:21-1227/R
  • 邮发代号:8-175
  • 获奖情况:
  • 1997年中共中央宣传部第二届全国优秀科技期刊三等奖,1999年辽宁省教委辽宁省普通高等学校优秀自然科学...,1999年教充部全国自然科学学报优秀期刊二等奖
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,波兰哥白尼索引,美国剑桥科学文摘,美国生物科学数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:19896