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一个与油菜黄化相关的未知功能基因克隆及表达
  • ISSN号:0490-6756
  • 期刊名称:《四川大学学报:自然科学版》
  • 时间:0
  • 分类:Q78[生物学—分子生物学]
  • 作者机构:[1]四川大学生命科学学院,成都610064
  • 相关基金:国家自然科学基金项目(30170500)
中文摘要:

以构建的油菜幼叶黄化突变体Cr3529消减文库中一个未知功能的差异表达基因片段为基础,应用RACE-PCR技术,扩增并克隆到两个cDNA全序列,分别命名为BnCr4和Bn—Cr4—1.测序结果显示,BnCr4编码区序列大小为1395bp,编码465个氨基酸,而BnCr4—1编码区序列长1311bp,编码437个氨基酸.BLAST结果表明它们与拟南芥中的一个未知功能基因的cDNA同源性分别为87%和80%.功能预测显示它们含有与蛋白质的修饰作用有关的多个活性位点,如磷酸化、糖基化、酰胺化以及磷酸泛酰巯基乙胺结合位点,可能是一种新的与cAMP介导的蛋白质磷酸化与去磷酸化作用有关的蛋白.Northen杂交结果显示该基因在Cr3529子叶期和幼叶期的表达高于野生型油菜,显示该基因的表达与突变性状紧密相关.最后,原核表达了BnCr4,得到了与预计分子量相同的融合蛋白.

英文摘要:

Two full-length cDNA sequences were amplified and cloned by RT-PCR and RACE-PCR according to a differentially expressed fragment of the backward subtraction library of young leaves in chlorophyll-reduced mutant Cr3529 of Brassica napus, named BnCr4 and BnCr4-1 respectively. They encoded 465 and 437 amino acids respectively. Results of BLAST in GentBank showed they shared 87 % and 85 % identity to the cDNAof an unknown function gene(accession number: At5g19540)in Arabidopsis thaliana, respectively. Prediction of protein function showed they contain multiple types of functional sites. Northern blots showed that the expression of the unknown gene presented more strongly in cotyledon and young leaves of chlorophyll- reduced mutant than that of wild type. The open reading frame of BnCr4 was cloned into expression vector pET-32a( + ), and then transformed into host bacterium, BL21 (DE3). The host cells were induced by IPTG. The molecular weight of the expressed protein in E. coli was identified with the deduced protein.

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期刊信息
  • 《四川大学学报:自然科学版》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:国家教育部
  • 主办单位:四川大学
  • 主编:刘应明
  • 地址:成都九眼桥望江路29号
  • 邮编:610064
  • 邮箱:
  • 电话:028-85410393 85412393
  • 国际标准刊号:ISSN:0490-6756
  • 国内统一刊号:ISSN:51-1595/N
  • 邮发代号:62-127
  • 获奖情况:
  • 国家“双效”期刊,四川省十佳科技期刊,教育部全国高校优秀学报二等奖(1995,1999),四川省科技优秀期刊一等奖(1996,2000)
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),美国数学评论(网络版),德国数学文摘,美国生物科学数据库,英国动物学记录,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:10542