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猪14-3-3蛋白家族基因生物信息学分析
  • ISSN号:0529-5130
  • 期刊名称:《畜牧与兽医》
  • 时间:0
  • 分类:S828.9[农业科学—畜牧学;农业科学—畜牧兽医]
  • 作者机构:[1]信阳师范学院生命科学学院遗传学研究所,河南信阳464000
  • 相关基金:国家自然科学基金(U1204326);河南省教育厅科学技术研究重点项目(128230015);信阳师范学院青年骨干教师资助计划项目(2011)
中文摘要:

14-3-3蛋白在哺乳动物中均有表达,是一类高度保守的酸性蛋白家族,广泛参与各种信号传导途径,具有十分重要的功能.本研究以猪的14-3-3蛋白家族为研究对象,运用生物信息学方法,首先对猪(Sus scrofa) 14-3-3蛋白家族基因组数据库进行搜素,获得猪14-3-3蛋白家族的7个亚型.然后通过对所有的猪14-3-3蛋白家族的DNA序列及各种表达序列标签(Expression Sequence Tags,ESTs)作进一步比对分析.结果表明:猪14-3-3蛋白家族的7个亚型在猪中均有表达;蛋白质多序列匹配分析表明猪14-3-3蛋白存在多个保守结构域,在各功能区段相当保守;通过基因结构分析、ESTs表达分析和蛋白质预测分析表明,14-3-3蛋白质家族均为亲水性蛋白,且不同亚型在猪体内不同组织表达,参与不同的生物学功能.本文将为猪14-3-3蛋白家族进一步的功能分析提供研究基础.

英文摘要:

The 14-3-3 protein, a kind of highly conservative member of acid protein family, is expressed in mammals, which plays an im- portant role in various signal transduction pathways. In this study, the porcine 14-3-3 protein family was analyzed by bioinformatics meth- od. Firstly, seven 14-3-3 protein subtypes were identified by searching the porcine gene database. Expression analysis also showed that sev- en 14-3-3 protein subtypes were expressed in different position of pigs. Alignment of amino acid sequences suggested that porcine 14-3-3 protein had multiple conservative structure domains. Porcine 14-3-3 proteins were hydrophilic proteins, while different subtypes had differ- ent tissue expression and functional biology. This paper could be helpful in further understanding of porcine 14-3-3 protein function analy-sis.

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期刊信息
  • 《畜牧与兽医》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:教育部
  • 主办单位:南京农业大学
  • 主编:石放雄
  • 地址:江苏省 南京市 卫岗1号南京农业大学内
  • 邮编:210095
  • 邮箱:muyizz@mnjau.edu.cn
  • 电话:025-84395701
  • 国际标准刊号:ISSN:0529-5130
  • 国内统一刊号:ISSN:32-1192/S
  • 邮发代号:28-42
  • 获奖情况:
  • 全国中文核心期刊,全国畜牧兽医期刊评比一等奖
  • 国内外数据库收录:
  • 中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:17624