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应用Label-free技术研究人牙囊细胞和牙周膜成纤维细胞的差异蛋白质
  • ISSN号:1005-2593
  • 期刊名称:《牙体牙髓牙周病学杂志》
  • 分类:R780.2[医药卫生—口腔医学;医药卫生—临床医学]
  • 作者机构:[1]陕西西安:军事口腔医学国家重点实验室,陕西省口腔医学重点实验室,第四军医大学口腔医院正畸科,710032, [2]解放军第323医院口腔科,710001
  • 相关基金:国家自然科学基金面上项目(81271176)
中文摘要:

目的:应用Label-free蛋白定量技术研究牙囊细胞(h DFCs)和牙周膜成纤维细胞(h PDLFs)差异表达蛋白质,为发现h DFCs向h PDLFs转化过程中的重要蛋白质提供参考。方法:应用Label-free蛋白定量技术,结合ultramate 3000 nano-UPLC软件,对h DFCs和h PDLFs总蛋白提取液进行蛋白定性定量检测。然后分别对蛋白质的鉴定结果行重复性、关联性、蛋白相对含量和差异表达蛋白等进行分析;对总体蛋白质和差异表达蛋白质行生物信息学GO或KEGG分析。结果:h DFCs和h PDLFs蛋白相对含量及总体蛋白GO分析结果相似。定量分析显示,当h DFCs分化形成h PDLFs后,有22个差异表达蛋白质,其中下调蛋白15个(P〈0.05,FC〉2),上调蛋白7个(P〈0.05,FC〉2)。结论:h DFCs和h PDLFs蛋白质表达谱相似;22个差异表达蛋白质为研究h DFCs向h PDLFs的转化机制提供了方向。

英文摘要:

AIM: To identify the differentially expressed proteins of human dental follicle cells( h DFCs) and human periodontal ligament fibroblasts( h PDLFs) with Label-free protein quantification technique. METHODS: Combined with ultramate 3000 nano-UPLC software,Label-free protein quantification was used to examine the total protein extraction samples from h DFCs and h PDLFs. For the proteins identified,the repeatability,the correlation,the relative content of proteins and the differentially expressed proteins of h DFCs and h PDLFs were analyzed. Bioinformatic analysis of GO and KEGG was applied for the analyses of total proteins of h DFCs and h PDLFs,as well as the differentially expressed proteins. RESULTS: The relative content of proteins and the results of GO analysis of h DFCs swere similar to those of h PDLFs. 22 differentially expressed proteins were identified,of which 15 were down-regulated,7 were up-regulated. CONCLUSION: Label-free quantitative proteomics confirmed the similar proteins profile between h DFCs and h PDLFs. 22 differentially expressed proteins provide clues for the transformation mechanism from h DFCs to h PDLFs.

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期刊信息
  • 《牙体牙髓牙周病学杂志》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:第四军医大学
  • 主办单位:第四军医大学口腔医学院
  • 主编:唐荣银
  • 地址:陕西省西安市长乐西路145号
  • 邮编:710032
  • 邮箱:kqytbk@fmmu.edu.cn
  • 电话:029-84776082
  • 国际标准刊号:ISSN:1005-2593
  • 国内统一刊号:ISSN:61-1254/R
  • 邮发代号:52-128
  • 获奖情况:
  • 1996年第二次全军医学期刊质量评比中获优秀编辑奖,1999年获陕西省优秀科技期刊一等奖
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,波兰哥白尼索引,美国剑桥科学文摘,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版)
  • 被引量:13034