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鸭甲状腺激素应答基因(THRSPα)比较基因组学研究
  • ISSN号:0366-6964
  • 期刊名称:《畜牧兽医学报》
  • 时间:0
  • 分类:S813.3[农业科学—畜牧学;农业科学—畜牧兽医]
  • 作者机构:[1]中国农业大学动物科技学院,北京100094, [2]安徽省农科院畜牧兽医研究所,合肥230031
  • 相关基金:国家杰出青年科学基金项目资助(30225032)
中文摘要:

为从比较基因组学角度研究鸭、鸡甲状腺激素应答Spot14alpha(THRSPα)基因突变的异同,根据对鸭THRSPα基因克隆和表达的研究结果,采用多样本PCR产物测序方法筛查鸭THRSPα基因编码区和部分内含子区的核苷酸变异,并与已知的鸡THRSPα基因编码区多态进行比较分析。结果表明:鸭THRSPα基因突变频率远高于鸡,编码区平均突变频率为每1000个碱基有23个碱基发生突变,内含子区平均每1000个碱基有28个碱基发生突变。编码区16个突变有3个为错义突变,其余均为同义突变。并且THRSPα蛋白靠近亮氨酸拉链结构域N端的第81位天冬氨酸(Asp81),在鸭中错义替换为缬氨酸(Val),在鸡中发生插入或缺失。提示鸭在进化过程中所受选择程度低于鸡,使其THRSPα基因碱基替换频率和分布均匀度均高于鸡,二者在脂肪性状相关的Asp81位点处均发生缺失或突变。

英文摘要:

To explore the mutation characteristic of the duck thyroid hormone responsive spot 14 alpha (THRSPα) gene cloned by the authors, the various PCR products covering the coding or intron regions of this gene were sequenced directly. The results showed that there was 23 single nucleotide polymorphisms (SNPs) per 1 000 nucleotides in the coding region compared to 28 SNPs per 1 000 nucleotides in intron region. The variations in the coding region contained three non-synonymous mutations and thirteen synonymous mutations. Furthermore, the 81th Aspartate (Asp81) was substituted to Valine near the N terminus of the leucine zipper domain of the duck THRSPα peptide, in contrast with the insertion/ deletion (indel) of the Aspartate in the same site of the chicken THRSPα. The study implicated that the less selective pressure made the duck THRSPα gene keep more frequent and balanced variations than that of the chicken counterpart during the course of bird domestication. The deeper exploration was necessary whether the non-synonymous substitution of the Asp81 locus for THRSPα gene was associated with fatness traits of the ducks.

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期刊论文 44 会议论文 12 获奖 10 著作 1
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期刊信息
  • 《畜牧兽医学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中国科学技术协会
  • 主办单位:中国畜牧兽医学会
  • 主编:文杰
  • 地址:北京海淀区圆明园西路2号中国农科院畜牧所
  • 邮编:100193
  • 邮箱:xmsyxb@263.net
  • 电话:010-62815987 62816996
  • 国际标准刊号:ISSN:0366-6964
  • 国内统一刊号:ISSN:11-1985/S
  • 邮发代号:82-453
  • 获奖情况:
  • 1992年北京优秀期刊奖,1998年、2000年在全国畜牧兽医优秀期刊评比中获一等奖
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,波兰哥白尼索引,美国剑桥科学文摘,英国动物学记录,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),瑞典开放获取期刊指南,中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:21857