证是中医学理论体系的核心概念,是充分体现中医整体观与辨证论治思想的重要概念之一。但半个多世纪以来的证候基础研究,多采用还原论、分析重构型、局部细化的研究方法。由于两者所依赖的理论依据迥然不同,缺乏实质性可结合位点,其研究结果及其价值便十分局限。本文基于课题组的系列国家自然科学基金项目的研究,着重从理论方面阐述,与证候基本特性相适应的研究策略与手段应当是足以展示证候整体观、动态观、系统观的“微观整体观”方法。而以功能基因组为代表的各种“组”学手段,以及系统生物学思想与方法,是目前生命科学领域较为恰当的首选技术平台。该研究成果是课题组实施之中的家族性肾阳虚转录组系列研究的重要理论基础。