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基于Multi-Agent生化反应模拟算法研究
  • ISSN号:1000-7024
  • 期刊名称:《计算机工程与设计》
  • 时间:0
  • 分类:TP311[自动化与计算机技术—计算机软件与理论;自动化与计算机技术—计算机科学与技术]
  • 作者机构:[1]哈尔滨工业大学(威海)计算机科学与技术学院,山东威海264209, [2]哈尔滨工业大学计算机科学与技术学院,黑龙江哈尔滨150001, [3]哈尔滨工业大学(威海)软件学院,山东威海264209
  • 相关基金:基金项目:国家自然科学基金项目(60803092).
中文摘要:

生物体内进行着大量错综复杂的生化反应,对生化反应网络的模拟是新兴的虚拟细胞仿真技术的核心任务,提出了一种基于多Agent的模拟虚拟细胞中生化反应通用算法。该算法基于虚拟细胞生化反应确定型算法,克服了确定型算法只能用于同一类型反应式,不易拓展至其它生化反应网络的缺点。该算法在Cougaar开发平台上进行了设计与实现,经过对热休克反应分析进行模拟测试,测试结果与生物学实验基本一致。

英文摘要:

Biochemical reaction network simulation is the core task in the new virtual cell simulation technology, because they carry out a lot of complex biochemical reactions. A new general algorithm is proposed to simulate the biochemical reactions in virtual cell using multi-agent. The algorithm is based on a deterministic algorithm for biochemical reactions in virtual cell, which overcomes the deterministic algorithm can only be used for the same type' s reactions, and the deterministic algorithm is not easy to expand to the other network of biochemical reactions. The algorithm completes the design and implementation in Cougaar development platform. Test results are mostly consistent with biological experiments after use the system to simulate the heat shock response reaction.

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期刊信息
  • 《计算机工程与设计》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中国航天科工集团
  • 主办单位:中国航天科工集团二院706所
  • 主编:汤铭瑞
  • 地址:北京142信箱37分箱
  • 邮编:100854
  • 邮箱:ced@china-ced.com
  • 电话:010-68389884
  • 国际标准刊号:ISSN:1000-7024
  • 国内统一刊号:ISSN:11-1775/TP
  • 邮发代号:82-425
  • 获奖情况:
  • 中国科学引文数据库来源期刊,中国学术期刊综合评价数据库来源期刊,中国科技论文统计与分析用期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 波兰哥白尼索引,美国剑桥科学文摘,英国科学文摘数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:45616