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干旱胁迫条件下发菜cphB差异表达与基因克隆
  • ISSN号:1674-568X
  • 期刊名称:《基因组学与应用生物学》
  • 时间:0
  • 分类:Q[生物学]
  • 作者机构:宁夏大学生命科学学院,银川750021
  • 相关基金:本研究由国家自然科学基金项目(31360054)资助
中文摘要:

发菜是一种分布在干早、半干旱荒漠草原地区的陆生固氮蓝藻,对干旱具有极强的适应性。采用qRT—PCR技术,对干旱胁迫条件下发菜cphB的差异表达进行了分析,发现干旱胁迫条件下发菜cphB在转录水平上呈逐渐增加的趋势。根据发菜同源物种设计简并性引物克隆cphB基因,获得长度为864bp的DNA(GenBank登陆号为KX092456)。同源性比较发现发菜cphB基因具有较高的保守性,二级结构预测表明发菜CphB由α螺旋,β折叠和随机卷曲构成。三级结构预测表明CphB具有一个由α螺旋和β折叠组成的5股的结构域和由7个β折叠连成三明治结构的7股的结构域。将cphB基因在大肠杆菌中表达,获得符合预期的外源重组蛋白,CphB亚细胞定位于细胞质中。研究成果为进一步研究干旱胁迫条件下发菜cphB表达调控、藻蓝素的代谢机制及能量代谢机制方面奠定了基础。

英文摘要:

Nostoc flagelliforme is a terrestrial nitrogen-fixing cyanobacte ria distributed in dry and semi arid desert steppe areas, which has strong adaptability to drought. We used qRT-PCR technique to analyze the differ- ential expression of ephB from Nostoe flagelliforme under drought stress conditions and found that cphB gradual- ly increased at the transcription level under drought stress. Degenerate primers were designed according to ho- mologous species of Nostoc flagelliforme to clone cphB gene, and a DNA with the full length of 864 bp was ob- tained (GenBank access number: KX092456). Homology comparison showed that cphB gene had high conser- vatism, and the secondary structure prediction indicated that CphB was made up of α Helix, 13 sheet and random coil. Besides, tertiary structure prediction demonstrated that CphB had a 5-stranded domain that composed of α Helix and β sheet and a seven-stranded domain composed of 7 β sheet with the structure like sandwich. The cphB was expressed in Escherichia coli, and the desired exogenous recombinant protein was obtained. In addi- tion, CphB subcellular was located in the cytoplasm. The results laid a foundation for further study on expres sion and regulation of cphB, metabolic mechanism of phycocyanin and energy metabolism in Nostoc flageUi- forme under drought stress.

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期刊信息
  • 《基因组学与应用生物学》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:广西大学
  • 主办单位:广西大学
  • 主编:朱玉贤
  • 地址:广西南宁市大学东路100号广西大学西校园《基因组学与应用生物学》编辑部111室
  • 邮编:530004
  • 邮箱:gab@hibio.org 571388455@qq.com
  • 电话:0771-3239102
  • 国际标准刊号:ISSN:1674-568X
  • 国内统一刊号:ISSN:45-1369/Q
  • 邮发代号:48-213
  • 获奖情况:
  • 全国优秀高校学校自然科学学报,教育部优秀科技期刊,广西优秀科技期刊,中国期刊方阵“双效”期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,美国剑桥科学文摘,英国动物学记录,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:4299